Thèse soutenue

Mécanismes moléculaires de reconnaissance de segments de régulation de l'ADN par des facteurs de transcription de la famille des “boîtes mads”
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Auteur / Autrice : Barbora Profantova
Direction : Pierre Yves Turpin
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biophysique, chimie, physique macromoléculaire
Date : Soutenance le 23/09/2014
Etablissement(s) : Paris 6 en cotutelle avec Univerzita Karlova (Prague)
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Chimie physique et chimie analytique de Paris Centre (Paris ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire Jean Perrin
Jury : Examinateurs / Examinatrices : Michel Manfait, Otakar Jelinek, Josef Stepanek, Germain Trugnan, Vladimir Baumruk

Mots clés

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Résumé

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Cette thèse concerne les propriétés physico-chimiques des " Boîtes MADS ", séquences de liaison de facteurs de transcription déterminantes pour la formation de complexes avec des segments de régulation de l'ADN comportant des séquences spécifiques nommées " Boîtes CArG ". Des études ont aussi été menées sur certains segments bien choisis des Boîtes MADS et quelques-uns de leurs analogues mutés. Un large choix d'approches spectroscopiques a été employé pour ces études : absorption électronique, dichroïsme circulaire, fluorescence et diffusion Raman. Des approches performantes d'analyse multivariée ont été utilisées pour le traitement des résultats expérimentaux. Les trois tyrosines de la Boîte MADS, situées dans des environnements de charge et d'hydrophobicité différents, ont été utilisées comme marqueurs spectroscopiques intrinsèques. Les principaux résultats de ce travail concernent les caractéristiques de structures, flexibilités et équilibres acido-basiques de la Boîte MADS et de ses différents segments.