Contribution des modèles à classes latentes à l’étude de la répartition spatio-temporelle des vecteurs de Paludisme et à l’étude temporelle de l’observance aux antirétroviraux chez les patients VIH

Contribution of latent class models to the study of the spatio-temporal distribution of malaria vectors and to the temporal study of adherence to antiretroviral treatment by HIV patients

• Auteur / Autrice : Olayidé Boussari
• Direction : René Écochard, Noël H. Fonton
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Statistiques appliquées
• Date : Soutenance le 16/06/2014
• Etablissement(s) : Lyon 1 en cotutelle avec Université d'Abomey-Calavi (Bénin)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation (Lyon ; 1999-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive
• Jury : Président / Présidente : André Garcia
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : René Écochard, Noël H. Fonton, Jean-François Etard
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Aliou Diop

Mots clés

Mots clés contrôlés

Antirétroviraux

Vecteurs de maladies

Paludisme

VIH (virus)

Mots clés libres

Hétérogénéité

Mesures répétées

Modèles de mélange

Classification non supervisée

Vecteurs de paludisme

Antirétroviraux

VIH/SIDA

Heterogeneity

Repeated measurements

Mixture models

Unsupervised classification

Malaria vectors

Antiretroviral

HIV/AIDS

Résumé

Ce travail est construit autour de deux problématiques de santé relatives aux deux plus grandes pandémies qui sévissent en Afrique sub-saharienne : i) l'hétérogénéité rencontrée dans la répartition spatiale et temporelle des vecteurs de paludisme ; ii) la variabilité dans l'observance au traitement antirétroviral par des personnes vivant avec le virus de l'immunodéficience humaine. Sur le plan méthodologique, ces deux problèmes se rapportent à la prise en compte de l'hétérogénéité dans la modélisation de données issues de mesures répétées ; ils nécessitent en outre le développement d'outils statistiques permettant de distinguer à partir des données, des sous-groupes (de localités, d'individus. . .) homogènes indispensables pour rendre plus efficientes les mesures de santé souvent déployer par les praticiens dans le cadre de la lutte contre le paludisme ou le VIH/SIDA. Les modèles de mélanges finis, grâce à leur flexibilité, sont des outils capables de fournir non seulement de bonnes estimations en présence d'une grande hétérogénéité dans les observations mais aussi une bonne partition des unités statistiques. Nous les distinguons, parmi d'autres méthodes, comme étant adaptés aux problématiques du présent travail. Deux applications de ces modèles aux données issues de capture de moustiques ont permis de modéliser la répartition spatiale et temporelle de vecteurs de paludisme et de dégager une méthode simple d'évaluation d'impact de mesures de lutte anti vectorielle. Nous introduisons la notion de _trajectoires de variances_ dans une troisième application portant sur des données d'observance aux traitements antirétroviraux par des personnes vivant avec le virus de l'immunodéficience humaine

This work focuses on two health issues relating to two major pandemics in sub- Saharan Africa : i) the heterogeneity encountered in the spatial and temporal distribution of malaria vectors ; ii) the variability in adherence to antiretroviral treatment by people living with the human immunodeficiency virus. Methodologically, these two problems are related to the consideration of the heterogeneity in the modeling of data from repeated measurements. They also require the development of statistical tools to distinguish from the data, homogeneous clusters of localities, individuals. . . that are needed to make more efficient health measures often deployed by practitioners in the fight against malaria and HIV/AIDS. The finite mixture models, due to their flexibility, are statistical tools that not only provide good estimates in the presence of heterogeneity in the observations but also a good classification of statistical units. We show that they are able to deal with the problematics of our study. The spatial and temporal distributions of malaria vectors are modeled through two different applications of finite mixture models and a simple tool to evaluate the impact of vector control methods is generated. We introduce a ”variance trajectories” method in a third application of finite mixture models to data on adherence to antiretroviral therapy by people living with human immunodeficiency virus