Interactions cytokiniques dans le microenvironnement inflammatoire : analyse à large échelle de la réponse aux Interférons de Type I lors la de polarisation des Lymphocytes T auxiliaires

Modulation of cytokine response by microenvironment : large-­scale analysis of Type IFN response during Human T Helper cells differentiation

• Auteur / Autrice : Maxime Touzot
• Direction : Vassili Soumelis
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Immunologie
• Date : Soutenance le 27/03/2013
• Etablissement(s) : Paris 11
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale Cancérologie : Biologie, Médecine, Santé (2000-2015 ; Le Kremlin-Bicêtre, Val-de-Marne)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Immunité et cancer (Paris ; 2009) - Immunité et cancer
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Biologie intégrative des cellules dendritiques et des cellules T chez l'homme
• Jury : Président / Présidente : Xavier Mariette
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Vassili Soumelis, Xavier Mariette, Lars Rogge, Valérie Julia, Denis Thieffry
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Lars Rogge, Valérie Julia

Mots clés

Mots clés contrôlés

VIH (virus)

Cytokines

Cellules T auxiliaires

Mots clés libres

IFN

Cytokine

Lymphocytes T auxiliaires

Analyse à large échelle

HIV

IFN

Cytokine

Th

Large-scale analysis

HIV

Résumé

Les interférons de Type I (IFN) sont des cytokines produites par les cellules en réponse à une infection virale. Les IFNs ont des effets pleïotropiques et parfois paradoxaux, protecteur ou néfaste pour l’immunité Innée ou adaptative. Certains facteurs intrinsèques (type cellulaire) peuvent expliquer une partie ces discordances. Mon travail de thèse s’est intéressé à l‘effet du microenvironnement cytokinique sur la réponse IFN. En utilisant des analyses à large échelle, nous avons étudié la réponse IFN dans 4 contextes de polarisation des lymphocytes T auxiliaires (Th). Nous avons identifié 1/ un programme de transcription conservé et 2/ une réponse IFN flexible, modulant spécifiquement les principales fonctions des Th (cytokines, chemokines) en fonction du contexte polarisant. La réponse antivirale apparait aussi flexible avec une moins bonne protection des Th2 et Th17 contre l’infection par HIV-1et HIV-2. Nos résultats suggèrent que l’environnement cytokinique contrôle en partie la réponse IFN et peut ainsi moduler cette dernière dans différents contextes physiopathologiques.

Type I IFN (IFN) are innate cytokines produced by host cells during viral infection. Ithas pleiotropic and sometimes opposing, protective or detrimental effects, on both innateand adaptive immunity that remain poorly understood. Parts of IFN response may be explain by intrinsic effect (cell-­‐specificity). My thesis was focused on the effect of the microenvironment, as present during T Helper cell differentiation, on IFN response. Using a systems level approach, we studied IFN responses during Four Human T Helper cell differentiation. We identified 1/ a conserved IFN-­‐induced transcriptional program comprising mostly antiviral genes 2/ a flexible IFN response, leading to a different pattern of chemokine and cytokine induction by IFN in distinct Th environments. Antiviral response was also flexible with a lesser protection to HIV-1 and HIV-2 infection in Th2 and Th17 contexts. Our in vitro results suggested that environmental control might shape the effects of IFN in different physiopathological contexts.