Déterminants moléculaires du tropisme du VIH de type 2, implications du tropisme dans la physiopathologie de l'infection et la prise en charge thérapeutique des patients

HIV type 2 tropism molecular determinants, implications in the pathophysiology of infection and therapeutic management

• Auteur / Autrice : Benoit Visseaux
• Direction : Diane Descamps
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Virologie
• Date : Soutenance en 2013
• Etablissement(s) : Paris 7

Mots clés

Mots clés contrôlés

méthodes

Techniques de génotypage

ARN viral

Tropisme viral

VIH-2 (Virus de l'Immunodéficience Humaine de type 2)

Résumé

Lors de l'entrée du VIH dans une cellule cible, le virus doit fixer un corécepteur qui peut-être le CCR5 ou le CXCR4. Le maraviroc est uniquement efficace sur les virus de tropisme R5. Le VIH-2 présente une résistance naturelle à 1/3 des antirétroviraux commercialisés. Il n'existait pas de méthode diagnostique de détermination du tropisme du VIH-2 et la sensibilité du VIH-2 au maraviroc était inconnue. Le tropisme viral phénotypique de 53 souches de VIH-2 a été déterminé et la boucle V3 a été séquencée pour analyser l'association des mutations observées avec le tropisme viral. La sensibilité phénotypique du VIH-2 au maraviroc a été déterminée sur un modèle de leucocytes de donneurs. Le tropisme génotypique a été comparé entre l'ARN viral et l'ADN proviral pour 43 prélèvements. Nous avons identifié 4 déterminants génotypiques majeurs associés à l'utilisation du CXCR4 (L18Z, V19K/R, insertion en position 24, charge nette de la boucle V3 >+6). Le VIH-2 a une sensibilité phénotypique au maraviroc équivalente au VIH-1, avec une CI50 médiane de 0,80 nM et un plateau maximal d'inhibition médian de 93 %. Le tropisme génotypique de l'ARN viral et de l'ADN proviral est concordant dans 74 % des cas. Dans ce travail nous avons établi le premier algorithme génotypique de détermination du tropisme du VIH-2 e observé une sensibilité in vitro du VIH-2 au maraviroc équivalente à celle du VIH-1. Nous avons établi la bonne concordance entre le tropisme viral de l'ARN circulant et de l'ADN proviral. Ces données permettent désormais l'identification des patients infectés par le VIH-2 éligible pour le maraviroc. Le caractère pronostic du tropisme viral va maintenant être évalué.

During HIV entry in target cells, the virus must attach a coreceptor: CR5 or CXCR4. Maraviroc is only effective on R5-tropic viruses. HIV-2 is a highly resistant virus with natural résistance to one third on HIV-1 effective antiretroviral drugs. HIV-2 infected patients often displayed a spontaneously undetectable viral load in absence of treatment. There was no assay for HIV-2 tropism determination and HIV-2 susceptibility to maraviroc remained unknown. We determined phenotypic tropism of 53 HIV-2 strains and sequenced the V3 loop. Association between the V3 loop sequence and the phenotypic viral tropism was analyzed. HIV-2 phenotypic susceptibility to maraviroc was studied with a PBMC model. Finally, concordance between genotypic tropism of viral RNA and proviral DNA was studied. We identified 4 HIV-2 major genotypic determinants associated with the use of CXCR4 (L18Z, V19K/R, an insertion at position 24, V3 loop global net charge >+6). HIV-2 phenotypic susceptibility to maraviroc is similar HIV-1, with a IC50 median of 0. 80 nM and a median maximum inhibition plate of 93%. Genotypic tropism of viral RNA and proviral DNA were concordant in 74% of tested samples. Ail discrepancies were due to R5 tropism in viral RNA and X4 tropism in proviral DNA. We developed the first HIV-2 algorithm for genotypic tropism prediction. We demonstrated in vitro susceptibility of HIV-2 to maraviroc. We have predicted the good correlation between genotypic viral tropism established from circulating RNA and proviral DNA. This allows identification of HIV-2 infected patients eligible for maraviroc treatment. HIV-2 tropism will now be examined for its predictive value of progression to AIDS.