Thèse soutenue

Recherche de cible des facteurs de transcription en cellules euraryotes

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Auteur / Autrice : Lydia Boudarène
Direction : Maxime DahanXavier Darzacq
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Frontières du vivant
Date : Soutenance en 2013
Etablissement(s) : Paris 7

Résumé

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La régulation de l'expression des gènes est un mécanisme étroitement régulé. Au coeur de ce système, les facteurs de transcription jouent un rôle majeur dans l'initiation de la transcription, en induisant le recrutement de la machinerie transcriptionelle sur les séquences régulatrices des gènes. Pour ce faire, les facteurs de transcription doivent trouver et se fixer sur leur séquence cible de -10 paires de bases, au sein d'un génome composé de plusieurs milliards de paires de bases, et ce, dans un laps de temps compatible avec celui des processus biologique. Le mécanisme de recherche de cible a été largement étudié au cours des quarante dernières années, de manière théorique, in vitro et in vivo chez les bactéries et les levures. Au cours de l'étude présentée dans cette thèse, l'introduction au sein du génome de cellules eucaryotes du système modèle bactérien Répresseur Tétracycline-Opérateur Tétracycline, représentant respectivement le chercheur et la cible, a permis de révéler que le chercheur explore le noyau en combinant un processus de diffusion libre en trois dimensions, des fixations non-spécifiques ainsi qu'une diffusion en une dimension le long de l’ADN. L'efficacité de fixation sur la séquence cible de notre système modèle s'est avérée être plus faible que prévue, impliquant la prise en compte d'autres paramètres, tels que la concentration locale de facteurs de transcription ou l'organisation spatiale de la chromatine afin d'avoir une compréhension globale du mécanisme de régulation de l'expression génique.