Caractérisation et recherche de facteurs liés à la virulence dans les espèces ''classiques'' et ''nouvelles'' de Brucella

Characterization and search for virulence-related factors in “Classical” and “New” Brucella species

• Auteur / Autrice : Bashir Saadeh
• Direction : David O'Callaghan, Alessandra Occhialini-Cantet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie Santé
• Date : Soutenance le 12/09/2013
• Etablissement(s) : Montpellier 1
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé (Montpellier ; Ecole Doctorale ; ....-2014)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Virulence bactérienne et infections chroniques (Nîmes)
• Jury : Président / Présidente : Pierre Corbeau
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : David O'Callaghan, Alessandra Occhialini-Cantet, Pierre Corbeau, Suzana Salcedo
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Alain Charbit, Jean-Jacques Letesson

Mots clés

Mots clés contrôlés

Glutamate décarboxylase

ARN non codants

Brucella

Mots clés libres

Brucella

Virulence

Petit ARN non-codant

Hfq

Glutamate Decarboxylase

Regulation post-transcriptionnelle dans les bactéries

Brucella

Virulence

Small non-coding RNA

Hfq

Glutamic Acid Decarboxylase

Post-transcriptional regulation of gene expression in bacteria

Résumé

L'étude qu'on a entreprise a pour but d'analyser les facteurs de virulence des espèces ''Classiques'' et ''nouvelles'' de Brucella. Dans cette perspective, on a analysé les génomes des espèces récemment découvertes : Brucella inopinata BO1 et Brucella inopinata-like BO2, isolés pour la première fois de patients humains sans réservoir animal connu. On a découvert que ces deux espèces possèdent des profils de restriction uniques. De plus, BO2 possède deux chromosomes de taille identique, un profil jamais décrit pour une autre espèce de Brucella. L'analyse de la réplication intracellulaire de ces deux espèces révèle que BO2 ne se réplique pas dans les macrophages humains et murins alors que BO1 se réplique d'une façon similaire à Brucella suis 1330, ce qui confirme la potentielle implication de BO1 dans la pathogenèse chez l'homme. Sur un autre niveau d'analyse, on a été à la recherche de facteurs de virulence potentiels dans d'autres espèces de Brucella notamment Brucella microti et Brucella suis sur les niveaux génomique et post-transcriptionnel. Sur le niveau génomique, on a découvert que le système GAD (glutamate decarboxylase) confère une résistance à l'acidité à Brucella microti lors de son passage dans l'estomac. Sur le niveau post-transcriptionnel, on a isolé, séquencé et identifié les petits ARNs noncodant associés à la protéine chaperone Hfq, qui joue un rôle important dans la virulence de Brucella.

We have undertaken in this study a multidimensional analysis of the virulence factors of ''Classical'' and new ''Brucella species''. In this objective, we have analysed the genomes of newly described species Brucella inopinata BO1 and Brucella inopinata-like BO2 isolated for the first time from human patients with no known animal reservoir. We found that these two species have unique restriction profiles. In addition, BO2 has a unique chromosomal distribution with two chromosomes of the same size, never seen before in Brucella. Analysis of the intracellular replication of these strains reveals that BO2 is unable to replicate in neither human nor mouse macrophages while BO1 successfully entered and replicated as efficiently as Brucella suis 1330 confirming the potential virulence of this species for humans. On an other level of analysis, we looked for potential virulence factors in other Brucella species including Brucella microti and Brucella suis at the genomic and post-transcriptional level. At the genomic level we discovered that the glutamate decarboxylase system confers resistance to acidity to Brucella miroti during its transit in the stomach. On the post-transcriptional level, we isolated, sequenced and identified small noncoding RNAs associated to the chaperone protein Hfq, known to play a role in the virulence of Brucella.