Etude structurale et fonctionnelle de la variante d'histone H2AZ

Structural and functional study of the histone variant H2AZ

• Auteur / Autrice : Arnaud Obri
• Direction : Ali Hamiche
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
• Date : Soutenance le 20/09/2012
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Bruno Chatton
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Mikhail Grigoriev, Dimitar Angelov

Mots clés

Mots clés contrôlés

Dissertations universitaires

Chaperons d'histones

ADN -- Synthèse (chimie)

ADN -- Réplication

Chromatine

Transcription génétique

Mots clés libres

Variante d’histone

H2AZ

Chaperonne d’histone

Anp32e

Transcription

Histone variant

H2AZ

Histone chaperone

Anp32e

Transcription

Résumé

La variante d’histone H2AZ joue un rôle important dans l’activation de la transcription, la prolifération cellulaire, le développement et la différentiation. H2AZ orne les promoteurs de la majorité des gènes, mais les mécanismes de bases de cette localisation sont inconnus. La compréhension de l’assemblage et du désassemblage du nucléosome passe par la caractérisation de la dynamique du nucléosome et des chaperonnes d’histones. L’objectif de ma thèse était d’identifier des chaperonnes spécifiques impliqués dans la dynamique de H2AZ en utilisant une approche de protéomique. Pour élucider les mécanismes de déposition/éviction de H2AZ, j’ai purifié le complexe prénucléosomale de H2AZ et j’ai caractérisé toutes les protéines associées. J’ai trouvé que Anp32e fait partie du complexe p400/TIP60 qui est présumée pour être responsable de l’échange d’H2AZ sur la chromatine. Anp32e présente une spécificité pour le dimère H2AZ-H2B, car il n’interagit pas avec le dimère H2A-H2B. L’interaction est accomplie au niveau d’une petite région dans le domaine d’ancrage sur H2AZ et au niveau d’un nouveau domaine ZID sur Anp32e. Finalement, j’ai montré que la suppression d’Anp32e entraine : un défaut dans la dé-répression des gènes dont l’expression est contrôlée par une hormone et une accumulation sur les promoteurs de ces derniers. Dans l’ensemble ces résultats identifient Anp32e comme une nouvelle chaperonne de la variante d’histoneH2AZ impliquée dans l’éviction de H2AZ chez les mammifères.

The histone variant H2AZ has emerged as a key regulator of chromatin function and plays an essential role in transcriptional activation, cell proliferation, development, and differentiation. H2AZ marks nucleosomes flanking the promoters of most genes, but the mechanistic basis for this localization is unknown. A mechanistic understanding of nucleosome assembly/disassembly requiresa detailed knowledge of nucleosome thermodynamics and histone chaperones. The aim of my thesis was to identify specific chaperone involved in H2AZ dynamic by using biochemical and proteomic strategies. To elucidate the mechanism of H2AZ deposition/eviction, I purified the prenucelosomal H2AZ complex and characterized in details the interacting protein partners. I found that Anp32e is a member of the presumed H2A.Z histone-exchange complex p400/TIP60. Bacterially expressed Anp32e binds only to the H2AZ/H2B dimers but not to the H2A/H2B. Anp32e interacts with a short region of the docking domain of H2A.Z. The binding occurred through a novel Anp32e motif, termed ZID. Finally, I show that down regulation of Anp32e interferes with both the de-repression of hormone dependent genes and H2A.Z removal from their promoter. Our data identified Anp32e as a novel mammalian H2AZ chaperone invoved in H2AZ eviction.