Thèse soutenue

Etude des gènes candidats positionnels du locus SPA2 de prédisposition aux spondylarthrites
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Auteur / Autrice : Amir Kadi
Direction : Gilles ChiocchiaMaxime Bréban
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie des Articulations et Biomatériaux des Tissus Calcifiés
Date : Soutenance en 2012
Etablissement(s) : Paris 7

Mots clés

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Résumé

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Les spondylarthrites (SpA) représentent le 2ème rhumatisme inflammatoire chronique le plus fréquent (prévalence dans la population adulte française de 0. 3%). La prédisposition génétique à la SpA estimée par le risque relatif de récurrence chez les germains (Xs = 40), n'est qu'en partie expliquée par sa forte association au HLA-B27. Ainsi, la part génétique de la région HLA a été estimée à 50% du risque génétique. L'objectif de ce travail est de parvenir à l'identification des facteurs génétiques de susceptibilité aux SpA situés dans la région SPA2 en 9q32, région dont notre équipe a rapporté la liaison aux SpA en 2004. Un criblage systématique de cette région par association intra-familiale nous a permis d'en réduire l'étendue à un intervalle accessible au re-séquencage systématique. La principale partie de mon travail a consisté dans l'étude d'un intervalle intergénique de 70 kb, situé, en aval de l'extrémité 3' du gène TNFSF15 et dont les analyses ont déterminé qu'il était au coeur de la liaison dans la région SPA2. Le re-séquençage exhaustif de cette région chez 24 patients indépendants provenant des familles les plus liées et 24 témoins a été achevé. Ce re-séquençage a permis de mettre en évidence une association extrêmement forte entre un haplotype étendu sur 3. 2 kb, et qui ségrége parfaitement avec la maladie. De plus, cette étude a permis l'identification d'un SNP intergénique fortement associé à la SpA, qui se localise dans un site putatif de fixation du facteur de transcription CEBP/beta, lui-même connu pour jouer un rôle important dans la régulation de l'expression de plusieurs cytokines pro-inflammatoires.