Génétique des populations et modèles d'architecture et de production végétale : application à la préservation des ressources génétiques des Mascarocoffea

par Domohina Noromalala Andrianasolo

Thèse de doctorat en Biologie Intégrative des Plantes

Sous la direction de Philippe de Reffye.


  • Résumé

    Les espèces de Mascarocoffea (61 sur 124 décrites endémiques de Madagascar) sont fortement menacées d'extinction à cause de la réduction considérable des surfaces forestières à Madagascar. En vue de leur préservation, l'évaluation du niveau de diversité dans la collection de Mascarocoffea de la station de Recherche du FOFIFA à Kianjavato comparé à celui de quatre populations en in situ a été faite. Le niveau de diversité des populations en collection est plus important que celui en in situ dont l'hétérozygotie observée est similaire avec une importante richesse allélique. La modélisation de la croissance et du développement des jeunes individus de ces populations par le modèle GreenLab a permis d'appréhender la mise en place de la structure de la plante en accord avec la variabilité architecturale interspécifique chez les populations étudiées à différents stades de développement. Un bon ajustement sur la croissance a été obtenu par la calibration des populations étudiées dans le dispositif expérimental. L'évolution de la variable clé du modèle GreenLab, le rapport source-puits (Q/D) en fonction du temps pour les 7 populations ajustées a montré que la production de beaucoup plus d'organes influence l'évolution du rapport Q/D au court du temps. Ce rapport affecte la taille des organes et l'architecture des Mascarocoffea. Un essai sur des individus adultes poussant dans des milieux différents (ex et in situ) dont les paramètres morphologiques, architecturaux et génétiques ont été déterminés dans cette étude, permettrait de déterminer la réponse des plantes selon l'environnement dans lequel elles poussent et de faire une optimisation du modèle. La détection des individus hybrides aussi bien in situ qu'en collection permet de voir ultérieurement la conséquence sur la structure de la plante et d'envisager d'intégrer les paramètres génétiques dans le modèle….

  • Titre traduit

    Population genetics and architectural-functional plant growth models : application to Mascarocoffea (coffee trees natives from Madagascar) genetic resources preservation


  • Résumé

    Mascarocoffea species (61 / 124 described, endemics to Madagascar) are highly endangered because of the considerable Madagascar area forest reduction. For their preservation, assessment of the Mascarocoffea diversity level in the FOFIFA Kianjavato Collection Research Station compared to four in situ populations was made. The collection population's diversity level is larger than that in situ, observed heterozygosity is similar with a significant allelic richness. Modeling the young individuals in these populations' growth and development by the GreenLab model helped to understand the development of the plant structure in accordance with the interspecific architectural variability in studied populations at different development stages. A good fitting on growth was obtained on the populations studied in the experimental plot. The evolution of the GreenLab model key variable, the source-sink ratio (Q / D), showed that the production of many more organs influences the ratio Q / D evolution in time. This variable affects organ size and Mascarocoffea architecture. An essay on adult individuals growing in different environments (in and ex situ), whose morphological, genetic and architectural parameters were determined in this study, would allow the plants response in terms of architecture depending on the environment in which they grow and to optimize the model. The detection of hybrid individuals in both in situ and at the collection would detect hybrids characters on the plant structure and consider integrating genetic parameters in the model....

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