Thèse soutenue

Modélisation de la mortalité bovine dans un objectif de surveillance épidémiologique
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Auteur / Autrice : Jean-Baptiste Perrin
Direction : Didier CalavasChristian Ducrot
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Épidémiologie
Date : Soutenance le 11/12/2012
Etablissement(s) : Lyon 1
Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (France ; 2010-....) - Institut National de la Recherche Agronomique (France). Unité de Recherche d'Epidémiologie Animale (Clermont-Ferrand, Puy-de-Dôme)
Jury : Président / Présidente : René Écochard
Examinateurs / Examinatrices : Gilles Salvat, Pascal Hendrikx
Rapporteurs / Rapporteuses : Loïc Josseran, Dominique Costagliola

Mots clés

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Résumé

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La surveillance syndromique est un concept récent en épidémiologie. Fondée sur le suivi automatisé d’indicateurs de santé non spécifiques, cette nouvelle approche offre des perspectives intéressantes pour la détection de phénomènes pathologiques émergents. Nous nous sommes basés sur les données actuellement collectées en France sur la mortalité bovine pour évaluer la faisabilité et la pertinence d’un système de surveillance syndromique basé sur cet indicateur. Nous avons d’abord modélisé le niveau de référence de la mortalité bovine en France puis proposé des méthodes pour identifier et quantifier d’éventuels excès de mortalité. Nous avons d’abord analysé des données réelles pour estimer rétrospectivement les conséquences sur la mortalité de l’épizootie de fièvre catarrhale ovine qui a touché le cheptel bovin français en 2007 et 2008. Nous avons ensuite proposé une méthode visant à identifier des regroupements d’unités spatiales présentant des augmentations inhabituelles de mortalité, et évalué ses performances pour détecter des foyers d’une maladie infectieuse dont nous avons simulé la propagation dans le cheptel bovin. Sur la base de ces travaux, nous discutons finalement de l’intérêt pour la protection de la santé animale d’un système de surveillance non spécifique basé sur la mortalité, et émettons des propositions pour la mise en place opérationnelle d’un tel système.