Thèse soutenue

Modélisation de la susceptibilité génétique non observée d’un individu à partir de son histoire familiale de cancer : application aux études d'identification pangénomiques et à l'estimation du risque de cancer dans le syndrome de Lynch
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Auteur / Autrice : Youenn Drouet
Direction : Christine LassetPascal Roy
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Statistique génétique
Date : Soutenance le 09/10/2012
Etablissement(s) : Lyon 1
Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation
Jury : Examinateurs / Examinatrices : Dominique Mouchiroud, Jacques Bénichou
Rapporteurs / Rapporteuses : Nadine Andrieu, Andrew Kramar, Fabrice Larribe

Résumé

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Le syndrome de Lynch est responsable d’environ 5% des cas de cancer colorectaux (CCR). Il correspond à la transmission d’une mutation,variation génétique rare, qui confère un haut risque de CCR. Une telle mutationn’est cependant identifiée que dans une famille sur deux. Dans lesfamilles sans mutation identifiée, dites négatives, le risque de CCR est malconnu en particulier les estimations individuelles du risque. Cette thèse comportedeux objectifs principaux. Obj. 1- étudier les stratégies capables de réduireles tailles d’échantillon dans les études visant à identifier de nouveauxgènes de susceptibilité ; et Obj. 2- définir un cadre théorique permettantd’estimer des risques individualisés de CCR dans les familles négatives, enutilisant l’histoire familiale et personnelle de CCR de l’individu. Notre travails’appuie sur la théorie des modèles mendéliens et la simulation de donnéesfamiliales, à partir desquelles il est possible d’étudier la puissance d’étudesd’identification, et d’évaluer in silico les qualités prédictives de méthodesd’estimation du risque. Les résultats obtenus apportent des connaissancesnouvelles pour la planification d’études futures. D’autre part, la cadre méthodologiqueque nous proposons permet une estimation plus précise durisque individuel, permettant d’envisager une surveillance plus individualisée.