Synthèse d'analogues de l'épicocconone par réaction d'oxydation désaromatisante : relation structure fluorescences et application en protéomique

Synthesis of epicocconone's analogues by oxydative dearomatization : structure-fluorescence relationship and application in proteomics

• Auteur / Autrice : Agathe Boulangé
• Direction : Xavier Franck, Stéphane Leleu
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance le 20/01/2012
• Etablissement(s) : Rouen, INSA
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale normande de chimie (Caen)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Chimie organique, bioorganique : réactivité et analyse (Mont-Saint-Aignan, Seine-Maritime ; 2000-....) - Chimie Organique et Bioorganique : Reactivité et Analyse / COBRA
• Jury : Président / Présidente : Laurent Micouin
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Stéphane Quideau, Jean-Claude Florent

Mots clés

Mots clés contrôlés

Fluorescence

Désaromatisation

Protéomique

Marqueurs biologiques

Protéines -- Électrophorèse

Mots clés libres

Epicocconone

Oxydation désaromatisante

Acylfuranone

Fluorescence

Protéomique

Oxidative dearomatization

Proteomic

Résumé

L’epicocconone est un produit naturel tricyclique de la famille des azaphilones isolé en 2003 d’un champignon Epicoccum nigrum. Ce composé se lie de façon covalente aux amines, conduisant à la formation d’une énamine fluorescente. Cette réaction, réversible en fonction du pH, fait de ce composé un excellent marqueur de protéines pour la détection sur gels d’électrophorèse compatible avec une analyse par spectrométrie de masse. La synthèse d’analogues de l’épicocconone a été engagée au sein de notre laboratoire, en basant sur une étape clé d’oxydation désaromatisante. Une étude approfondie de cette réaction a permis de mettre en évidence une haute diastéréosélectivité en fonction des conditions opératoires.Après introduction d’un cycle acylfuranonique diversement fonctionnalisé, une série d’analogues de l’épicocconone a été obtenue permettant d’établir la relation structure fluorescence et évaluer l’utilisation de ces biomarqueurs en protéomique.

Epicocconone is a tricyclic natural product of azaphilone family, isolated from the fungus Epicoccum nigrum. This compound covalently binds to primary amines, leading to a protein linked conjugate which is strongly fluorescent. This reaction, reversible according to the pH, makes of this compound an excellent proteins dye compatible with an analysis by mass spectrometry. Synthesis of epicocconone’s analogues has been undertaken in our laboratory.This synthesis is based on a key oxidative dearomatization. A study of this reaction allowed us to shed light on a high diastereoselectivity according to reaction conditions. After introduction of functionalized acylfuranone ring, a library of epicocconone’s analogues was obtained allowing us to establish the structure-fluorescence relationship and to estimate the use of these biomarkers in proteomics.