Etudes structurales et dynamiques du système de transport bactérien FhaB/FhaC et du complexe de réplication des Rhabdoviridae

Structure and dynamics of the bacterial transport systen FhaC/FhaB of Bordetella pertussis and of the replication complex of Rhabdoviridae

• Auteur / Autrice : Nicolas Martinez
• Direction : Joseph Zaccai, Marc Jamin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Physique
• Date : Soutenance le 15/03/2012
• Etablissement(s) : Grenoble
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale physique (Grenoble ; 1991-....)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Institut LAUE LANGEVIN
• Jury : Président / Présidente : Judith Peters
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Joseph Zaccai, Marc Jamin, Isabelle Landrieu, Jörg Mayer, Pierre Suquet, Carlo Nipoti
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Marie-christine Maurel, Rene Wintjens, Didier Gourier

Mots clés

Mots clés libres

Diffusion de neutrons

Complexes macromoleculaires

Dynamique

Structure

Neutron Scattering

Macromolecular complexes

Dynamics

Structure

Résumé

L'objectif de la thèse était d'étudier les propriétés structurales et dynamiques de deux systèmes biologiques, avec une approche centrée sur les techniques de diffusion de neutrons. Les premier système biologique porte sur le système de transport FHA/FhaC de la bactérie à Gramm négatif Bordetella pertussis. C'est un modèle pour le système de transport bactérien à deux partenaires (TPS), qui est largement utilisé par de nombreuses bactéries à Gramm negatif, essentiellement pour excréter des facteurs de virulence. Cette thèse comporte une analyse structurale sur le complexe chaperonneprotéine client Fha30/Par27 mais aussi une étude sur les propriétés mécaniques de Fha30, qui possède une structure particulière en hélice beta. Le deuxième système porte sur le complexe de réplication des virus de la famille des Rhabdoviridae. Outre son importance en termes de santé humaine, le complexe de réplication comporte des protéines aux propriétés qui, sur le plan structural, sont très intéréssantes, comme par exemple la phosphoprotéine qui comporte des parties structurées reliées par des parties dépourvues de structure. On trouvera dans cette thèse une étude des propriétés dynamiques des différents domaines de la phosphoprotéine, mais aussi une étude structurale sur le complexe que celle-ci forme avec la nucleoprotéine.

The main goal of this thesis is to study the dynamical and structural properties of two biological systems, with an aproach centered on neutron scaterring techniques. The first system consists of the transport system FhaB/FhaC from Gramm negative bacteria Bordetella pertussis. It is a model system for the so called Two Partner Secretion (TPS) system, wich is widespread among Gramm negative bacteria to export virulence factors to the medium. This thesis emphasizes on the complexe Fha30, a N-terminal fragment of FHA, forms with the periplasmic chaperonne Par27, and on the mechanical properties of FHA, which has an uncanny beta helix structure. The other system is the replication complex of the Rhabdoviridae virus family. Apart from it's importance in humant health issues, the replication complex is composed of proteins with interesting structural and dynamical properties, specially the phosphoprotein which is composed of structured parts linked by flexible linkers. This thesis emphasizes on the dynamical properties of different fragments of the phosphoprotein, but also on the structural aspects of the complex the latter forms with the nucleoprotein. . Le deuxième système porte sur le complexe de réplication des virus de la famille des Rhabdoviridae. Outre son importance en termes de santé humaine, le complexe de réplication comporte des protéines aux propriétés qui, sur le plan structural, sont très intéréssantes, comme par exemple la phosphoprotéine qui comporte des parties structurées reliées par des parties dépourvues de structure. On trouvera dans cette thèse une étude des propriétés dynamiques des différents domaines de la phosphoprotéine, mais aussi une étude structurale sur le complexe que celle-ci forme avec la nucleoprotéine.