Structure des assemblages de diatomées benthiques en rivière : l'environnement explique-t-il tout ? : processus écologiques et développement méthodologiques
Auteur / Autrice : | Marius Bottin |
Direction : | Michel Coste, Sovannarath Lek, Didier Alard |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés |
Date : | Soutenance le 28/06/2012 |
Etablissement(s) : | Bordeaux 1 |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Sciences et Environnements (Talence, Gironde ; 1999-....) |
Partenaire(s) de recherche : | Institut : Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture |
Jury : | Examinateurs / Examinatrices : Janne Soininen, Juliette Tison-Rosebery |
Rapporteurs / Rapporteuses : Jean-Pierre Descy, Isabelle Lavoie |
Résumé
Les diatomées sont des algues microscopiques qui sont largement utilisées pour évaluer la qualité écologique des cours d'eau.Les méthodes utilisées se basent sur des modèles simplifiés de biologie des communautés, dans lesquels seules les réponses individuelles des espèces à l'environnement sont prises en compte.Le test de l'importance de processus complémentaires a montré un impact fort des dynamiques de colonisation des espèces, mais un impact négligeable des phénomènes de compétition ou de facilitation.Ces processus impliquent une structure des assemblages bien plus complexe que celle habituellement assumée par les méthodologies de bioindication.L'adaptation et la mise en oeuvre de méthodes de réseaux de neurones et de logique floue nous ont permis de redéfinir des éco-régions françaises et de décrire des relations générales entre les traits biologiques des espèces et l'environnement, tout en prenant mieux en compte cette complexité.