Analyse du transcriptome de Trichoderma reesei pour l'amélioration de la production de cellulases

Analysis of Trichoderma reesi's transcriptome for cellulase production improvement

• Auteur / Autrice : Thomas Portnoy
• Direction : Stéphane Le Crom
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Science de la Vie
• Date : Soutenance en 2011
• Etablissement(s) : Paris 6

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bioéthanol

Transcriptome

Cellulase

Trichoderma

Résumé

Le champignon filamenteux Trichoderma reesei constitue la principale source de cellulases, enzymes employées dans les procédés industriels d’hydrolyse de la biomasse lignocellulosique nécessaire à la production de bioéthanol de deuxième génération. Ce projet de thèse se base sur l’utilisation de techniques de génétique moléculaire et d’outils de génomique fonctionnelle pour décrire les mécanismes génétiques impliqués dans la synthèse et la sécrétion de ces enzymes afin d’envisager une amélioration des capacités de production des souches de T. Reesei rationnellement et de manière ciblée. Une première partie de ce travail a consisté à préciser la régulation de l’expression des facteurs de transcription centraux de la production de cellulases lors d’une induction par le lactose. Nous avons notamment démontré que xyr1, ace1 et ace2 étaient spécifiquement induits par le lactose, et que CRE1, médiateur de la répression catabolique, était nécessaire à une induction complète de xyr1 et ace2. Dans un deuxième temps, des études transcriptomiques nous ont permis (i) d’identifier les gènes cibles de la répression catabolique dépendante ou non de CRE1, et (ii) de décrire à l’échelle du génome total les régulations mises en jeu lors de l’induction de la production de cellulases. Nos travaux ont notamment permis d’établir l’importance de l’expression génétique basale dans l’acquisition des capacités d’hyperproduction des souches, et d’identifier les principales fonctions cellulaires soumises à des régulations au cours du processus d’induction. L’ensemble de ces résultats permet d’orienter avec précision les stratégies d’amélioration des souches de T. Reesei par ingénierie génétique