Etude de la diversité des microorganismes thermophiles des sources thermales de Tunisie

Study of the microbial diversity of the Tunisian hot springs

• Auteur / Autrice : Raja Sayeh
• Direction : Daniel Prieur, Moktar Hamdi
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 2011
• Etablissement(s) : Brest

Mots clés

Mots clés contrôlés

Sources thermales

Tunisie

Microorganismes thermophiles

Résumé

Les sources thermales de Tunisie sont localisées dans tout le pays avec une concentration dans le sud et le nord est (région de Korbous). La majorité de ces sources sont exploitées essentiellement en thalassothérapie et pour alimenter des bains thermaux (hammam). Si des collections d'isolat ont été obtenues a partir de quelques unes de ces sources, les travaux d'écologie microbiennes sur ces environnements sont très peu nombreux et la diversité microbienne d'un grand nombre de ces sources demeure inconnue. En conséquence, une approche moléculaire a été réalisée afin d'analyser la diversité microbienne globale de ces sources. Grâce à l'analyse de l'ADNR 16S extraits des sédiments et de l'eau, les groupes microbiens les plus dominants ont été sélectionnés et des banques de clones archaea et bacteria ont été construits pour chaque source. Cette étude a donc permis : I) de décrire la diversité microbienne des sources thermales les plus chaudes de la Tunisie. II) de déterminer les paramètres influençant cette diversité. En complément, des cultures d’enrichissements ont été effectués et ont permis de : III) construire une collection d'isolats dont quatre nouvelles espèces appartenant aux genres anoxybacillus, thermosipho, fervidobacterium et thermoanaerovibrio qui ont été décrites.

Many thermal springs are localised in Tunisia mainly in the south and in the nort-east (area of Korbous) part of the country. The water of these springs is generally used in thalassotherapy and for thermal baths (hammam). Some isolates have been previously obtained but the microbial diversity of many of these springs was still unknown. A molecular approach was carried out in order to analyze the total microbial diversity of theses sources. The analysis of the 16S RDNA extracted from water and sediments showed dominants groups of microorganisms. The present study allowed : 1) to describe the microbial diversity of the hottest Tunisian thermal springs, 2) to determine the parameters influencing this diversity. In addition, many microorganisms have been isolated from these springs, four of which have been described in our laboratory as a new species belonging to genera : anoxybacillus, thermosypho, fervidobacterium and thermoanaerovibrio.