Étude de deux autolysines à activité N-acétylglucosaminidase chez Clostridium perfringens et Clostridium difficile

Study of two autolysins with N-acetylglucosaminidase activity of Clostridium perfringens and Clostridium difficile

• Auteur / Autrice : Émilie Camiade
• Direction : Jean-Louis Pons, Bruno Dupuy
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie. Microbiologie
• Date : Soutenance en 2010
• Etablissement(s) : Rouen

Mots clés

Mots clés contrôlés

Peptidoglycanes

Vancomycine

Cellules -- Séparation

Autolysines

Clostridium perfringens

Clostridioides difficile

Mots clés libres

Peptidoglycane hydrolases

N-acétylglucosaminidase

Résumé

L'objectif de ce travail était de caractériser et d'étudier le rôle de deux peptidoglycane hydrolases à activité N-acétylglucosaminidase chez Clostridium perfringens et Clostridium difficile. Les peptidoglycane hydrolases possèdent en effet un rôle essentiel dans la croissance bactérienne, peuvent contribuer à la virulence de certaines espèces pathogènes, et peuvent être impliquées dans l'activité bactéricide des antibiotiques inhibiteurs de la synthèse de la paroi. Le lien phylogénétique des genres Staphylococcus et Clostridium nous a permis de caractériser, par analyse génomique, deux gènes de peptidoglycane hydrolases, acp et acd chez C. Perfringens et C. Difficile. Acp et Acd ont une organisation modulaire comparable comprenant un domaine catalytique à activité N-acétylglucosaminidase en C-terminal et un domaine d'ancrage composé de séquences répétées à motifs SH3_3 en position N-terminale. L'étude des fonctions de ces deux peptidoglycane hydrolases a ensuite été réalisée grâce à la construction de leurs mutants respectifs. Acp se révèle être impliquée (i) dans la séparation des cellules filles de C. Perfringens lors de sa croissance et (ii) dans la réponse à la lyse induite par les sels biliaires et la vancomycine. En ce qui concerne Acd de C. Difficile, son activité est vraisemblablement compensée par d'autres peptidoglycane hydrolases actuellement en cours de caractérisation.

The objective of this work was to characterize and study the function of two peptidoglycan hydrolases from Clostridium perfringens and Clostridium difficile. Peptidoglycan hydrolases are implicated into the bacterial growth, may contribute to the virulence of certain pathogenic species and can be implicated in the bactericidal effect of cell wall-targeting antibiotics. The phylogenetic link between Staphylococcus and Clostridium allowed us to characterize, by genomic analysis, two genes of peptidoglycan hydrolases, Acp and Acd in C. Perfringens and C. Difficile. Acp and Acd have a modular organization composed of a C-terminal catalytic domain with N-acetylglucasaminidase activity and an anchoring domain composed of SH3_3 repeated sequences. Acp is involved (i) in the daughter cells separation of C. Perfringens during growth and (ii) in response to bile salts and vancomycin induced-lysis. For Acd of C. Difficile, its activity seems to be compensated by other peptidoglycan hydrolases that are actually in characterization.