Auteur / Autrice : | Hong Ha Nguyen |
Direction : | Suzanne Sommer |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Sciences biologiques |
Date : | Soutenance en 2010 |
Etablissement(s) : | Paris 11 |
Partenaire(s) de recherche : | autre partenaire : Université de Paris-Sud. Faculté des sciences d'Orsay (Essonne) |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Résumé
Deinococcus radiodurans est une des bactéries les plus radiorésistantes. La structure compacte du nucléoïde pourrait participer à la radiorésistance en limitant la diffusion des fragments d’ADN générés après irradiation. Ma thèse porte sur l’étude des protéines qui sont associées au nucléoïde de D. Radiodurans telles que HU, Dps1 et Dps2 et des protéines connues pour jouer un rôle dans la structuration de l’ADN, telles que SMC et les ADN-topoisomérases. J’ai démontré que HU de D. Radiodurans est essentielle à la viabilité cellulaire et joue un rôle majeur dans la compaction et la structuration du nucléoïde. Sa déplétion progressive induit d’abord un fractionnement en plusieurs entités du nucléoïde puis sa décompaction totale suivie de la lyse cellulaire. L’expression de son homologue le plus proche, HU de Deinococcus deserti, important pour la radiorésistance chez cet organisme, peut compenser l’absence d’HU chez D. Radiodurans. L’extension N-terminale d’une quarantaine d’acides aminés de ces deux protéines HU est essentielle à leur fonctionnalité. Par contre, l’expression de la protéine HUd’E. Coli ne peut pas complémenter l’absence de HU et perturbe la croissance de D. Radiodurans. Inversement, celle de HU de D. Radiodurans chez E. Coli perturbe la division cellulaire et induit la filamentation. La déplétion des protéines Dps1, Dps2 ou SMC chez D. Radiodurans n’induit aucun phénotype concernant la structure du nucléoïde, la croissance cellulaire et la radiorésistance à l’exception d’une sensibilité accrue du mutant dépourvu de SMC aux inhibiteurs de l’ADN-gyrase. HU serait donc une des protéines majeure responsable de la structuration du nucléoïde chez D. Radiodurans.