Recherche Avancée

Thèse soutenue

Etude moléculaire et biochimique des interactions de la protéine hnRNP G avec l’ARN

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Auteur / Autrice : Rasha Kanhoush
Direction : May Penrad-Mobayed
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biochimie et biologie moléculaire
Date : Soutenance en 2010
Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

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La protéine hnRNP G est impliquée dans l’épissage alternatif de plusieurs précurseurs d’ARN messager. Pour mieux comprendre la spécificité de cette protéine, j’ai étudié ses interactions avec les ARNs in vitro et in vivo. Un motif d’ARN structuré dans une tige-boucle qui contient la séquence GGAAA a été identifié in vitro comme une cible potentielle d’hnRNP G. Cet ARN m’a permis d’identifier un nouveau domaine d’interaction avec l’ARN dans la structure de l’hnRNP G, situé dans sa région C-terminale et désigné « C-ter RBD ». Le modèle des chromosomes en écouvillon chez l’amphibien m’a permis de montrer qu’un nouveau domaine situé au centre de la structure de la protéine et distinct de ses domaines d’interaction avec l’ARN est responsable de son recrutement au niveau des transcrits naissants des chromosomes. Ce domaine a été désigné Nascent transcripts Targeting Domain (NTD). Cette étude montre que l’hnRNP G s’associe avec la majorité des ARNs transcrits par l’ARN polymérase II tout en montrant un recrutement plus important au niveau de quelques boucles des chromosomes. En particulier, l’association de l’hnRNP G avec les transcrits du bivalent sexuel ZW chez Pleurodeles waltl, montre un recrutement hétéromorphe au niveau de certains sites de ce bivalent. Au cours de ma thèse, j’ai participé à la mise en évidence d’une activité différentielle de liaison à l’ARN liée au génotype sexuel, pour les isoformes de l’hnRNP G dans l’ovocyte de P. Waltl. Les résultats suggèrent la présence d’une famille multigénique de l’hnRNP G répartie sur un autosome et sur les chromosomes sexuels. Cette étude contribue à la caractérisation de l’hnRNP G et à la compréhension de ses fonctions.