Compréhension de la diversité génotypique et phénotypique générée chez Escherichia coli lors des infections extraintestinales

Diversification of fitness strategies in Escherichia coli clones during extraintestinal infections

• Auteur / Autrice : Maxime Levert
• Direction : Odile Hablot-Bouvet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 2010
• Etablissement(s) : Paris 5

Mots clés

Mots clés contrôlés

Intestins

Dissertations universitaires comme sujet

microbiologie

Infections à Escherichia coli

Escherichia coli

Résumé

Ce travail a consisté à obsever et étudier les mécanismes responsable de la diversification génotypique et phénotypiques des clones d'E. Coli lors des infections extraintestinales. Plusieurs polymorphismes phénotypiques s'expliquent par des niveaux différents de la protéine RpoS dans les isolats. L'étude fine des isolats d'un patient n'a pas permis de détecter de mutations dans le gène RpoS mais le séquençage de quatre de ces souches a permis de découvrir au moins six mutations ponctuelles, une délétion et une insertion d'élément IS;. La moitié présentant un lien direct avec l'expression de certaines protéines differentiellement exprimées. En utilisant un modèle murin d'infection extraintestinale, nous avons observé que ces 8 isolats se partagent en 4 groupes de virulence significativement distincts. Les résultats montrent qu'il est possible que de multiples génotypes et phénotypes bactériens soient générés à partir d'une population clonale dans les infections extraintestinales à E. Coli|

This work consisted to observe and study the mechanisms responsible for the genotypic and phenotypic diversification of clones E. Coli in extraintestinal infections. Several phenotypic polymorphisms are explained by different levels of RpoS protein in the isolates. The detailed study of isolates from one patient failed to detect mutations in the gene RpoS but four of these strains revealed at least six point mutations, a deletion and an insertion of IS element; half of the mutations are linked with the expression of certain proteins differentially expressed. Using a mouse model of extraintestinal infection, we observed that these 8 isolates were divided into 4 groups of significantly different virulence. The results show that it is possible that multiple bacterial genotypes and phenotypes are generated from a clonal population in extraintestinal infections E. Coli.