Le Génome mitochondrial des Mammifères et les données moléculaires hypervariables dans la description de l'histoire évolutive des Arvicolinae

Mammalian mitochondrial genome and hyper variable molecular data in the description if the Arvicolinae evolutionary history.

• Auteur / Autrice : Cédric Delsol
• Direction : Nicolas Galtier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biochimie et biologie moléculaire
• Date : Soutenance le 14/12/2010
• Etablissement(s) : Montpellier 2
• Ecole(s) doctorale(s) : Systèmes Intégrés en Biologie, Agronomie, Géosciences, Hydrosciences, Environnement (Montpellier ; École Doctorale ; 2009-2014)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut des sciences de l'évolution (Montpellier)
• Jury : Président / Présidente : Emmanuel Douzery
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Nicolas Galtier
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Anne Chenuil, François Pompanon

Mots clés

Mots clés contrôlés

Arvicolinés

Mitochondries

Phylogénie

Mots clés libres

Taux d'évolution

Phylogénomique

Mitochondrie

Arvicolinae

Microtus

Evolutionnary rate

Phylogenomic

Mitochondria

Arvicolinae

Microtus

Résumé

L'acquisition, en laboratoire, des génomes mitochondriaux complets de plusieurs espèces de rongeurs Arvicolinae permet la définition de l'histoire évolutive du groupe dans un cadre évolutif et temporel. Ces relations phylogénétiques sont inférés sur un grand nombre de caractères (16000 pb), grâce à des méthodes d'analyses statistiques novatrices.La base de données moléculaires constituée représente un échantillon de génomes mitochondriaux à évolution dite ''rapide'', ouvrant des perspectives quant à la description des points chauds mutationnels dans des études de génomique comparative, et permettant d'identifier plus globalement la source de l'hétérogénéité des taux de substitution mitochondriale au sein des génomes mitochondriaux des Mammifères.

Experimental acquisition of complete mitochondrial genome for several Arvicolinae species allows defining evolutionary history of the group in evolutionary and temporal frames. These phylogenetic relationships are inferred on a great number of characters (16000 bp), thanks to innovator statistical analysis methods.Constituted molecular data set represents a sample of ''fast evolving'' mitochondrial genomes, and allows describing mutational hots spots in comparative genomic studies, and identifying globally the origin of mitochondrial substitution rate heterogeneity detected in Mammalian mitochondrial genomes.