Relation Métabolisme Central Carboné et réplication de l’ADN : vers l’identification d’un réseau complexe de communication chez la bactérie Bacillus subtilis

Relation Control Carbon Metabolism and DNA replication : towards the identification of a complex network of communication in the bacteria Bacillus subtilis.

• Auteur / Autrice : Anne-Françoise Monnier Batto
• Direction : Victor Norris, Laurent Jannière
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie. Génétique microbienne
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Rouen

Mots clés

Mots clés contrôlés

Spectrométrie de masse des ions secondaires

Bacillus subtilis

Mots clés libres

MCC (Métabolisme Central Carbone)

Réplication

Résumé

Pour survivre et pour croître de façon optimale, les cellules ont développé des systèmes de régulation qui leur permette d’ajuster l’activité de leurs principales fonctions biologiques (réplication, transcription et traduction) à la richesse du milieu environnant (Bremer et Dennis 1987). Dans cette thèse, nous nous intéressons à la régulation de la réplication chez la bactérie Bacillus subtilis. Les acteurs et les mécanismes de cette régulation restent inconnus. Mais chez Bacillus subtilis, nous avons identifié des voies possibles de signalisation : le bas de la glycolyse et certaines enzymes de réplication, (Jannière et al. 2007, PLoS ONE. 2 :e447) et nous avons montré que ce couplage entre le métabolisme central carboné et la réplication était indépendant du ppGpp. En parallèle, une nouvelle méthode d’étude de la réplication de l’ADN a été développée. Cette méthode repose sur l’imagerie nanoSIMS 50. Nous montrons qu’elle permet la détection et la quantification précise du marquage de l’ADN peigné. En perspective, l’utilisation de cette nouvelle méthode devrait apporter des éléments nouveaux à notre compréhension des mécanismes du couplage MCC/ réplication.

To survive and to grow in optimal fashion, cells have developed systems of regulation which allow to adjust the activity of principal biological functions (replication, transcription and translation) to the richness of the environment (Bremer et Dennis 1987). In this thesis, we are interested about the regulation of replication in the bacteria Bacillus subtilis. The actors and the mechanisms of this regulation are unknown. But, in Bacillus subtilis, we identified some possible signalization pathways: the bottom of glycolysis and certain replication enzymes (Jannière et al. 2007, PLoS ONE. 2 :e447) and we showed that the link between the central carbon metabolism and replication is independent of the ppGpp. In parallel, we have developed a new method for studying the DNA replication. This method, which is based on imaging using a NanoSIMS 50, allows the detection and the precise quantification of combed DNA. This method promises to give new insight into the interactions of the link between CCM and replication.