Puissance du modèle canin pour les études d'associations : application à la texture du poil et au sarcome histiocytaire

Power of the dog model for association study : application to the hair texture and histocytic sarcoma

• Auteur / Autrice : Édouard Cadieu
• Direction : Catherine André, Elaine A. Ostrander
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Rennes 1 en cotutelle avec National Human Genome Research Institute (Etats-Unis)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Vie-Agro-Santé (Rennes)
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université européenne de Bretagne (2007-2016)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Système pileux

Sarcome

Génotype

Phénotype

Ressources génétiques

Chien

Résumé

Ce travail de thèse montre la puissance du modèle canin pour effectuer des études d’association. Grâce aux ressources génomiques et à la structure de la population canine, les traits complexes peuvent être disséqués en composantes simplifiées. Trois phénotypes du pelage ont été étudiés : la longueur, la texture bouclée et le phénotype « moustache ». Après étude d’association et cartographie fine, nous avons identifié les gènes et les mutations associés à ces trois phénotypes et démontré que la combinaison allélique des trois mutations explique 95% des phénotypes de pelage chez le chien. La seconde partie de la thèse a été l’étude d’un sarcome histiocytaire chez le bouvier bernois. A partir d’un pedigree français, sur des analyses épidémiologiques nous avons proposé un mode de transmission oligogénique. Suite à une étude d’association sur 250 individus américains, un locus a été identifié sur le chromosome 11 dont la cartographie fine est en cours.

This thesis demonstrates the power of the canine model to perform association studies. The genomic resources and the canine population structure make possible to dissect complex traits into simplified components. We studied three fur phenotypes: the length, the curly texture, and the « furnishings ». After several association studies and fine mapping, we identified the genes and the mutations involved in those three phenotypes and showed that the allelic combinations of those mutations explain 95% of the canine fur phenotype. The second part of this thesis concerned the study of a histiocytic sarcoma in the Bernese mountain dog breed. From the study of a French pedigree, we proposed an oligogenic transmission mode. An association study involving 250 American dogs showed a significant locus on chromosome 11 that is currently fine mapped.