Etude du processus d'entrée du VIH-1 par modélisation moléculaire : application à la conception de nouveaux inhibiteurs potentiels

Molecular modelling study of entry HIV-1 gp120 and gp41 inhibition : application to the design of new potential antiretroviral agents

• Auteur / Autrice : Catia Andreia Teixeira
• Direction : Florent Barbault
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie informatique et théorique
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Paris 7

Mots clés

Mots clés contrôlés

Conformation moléculaire

Modèles moléculaires

Relation quantitative structure-activité

Inhibiteurs de la transcriptase inverse

Protéine d'enveloppe gp41 du VIH

Protéine d'enveloppe gp120 du VIH

VIH-1 (Virus de l'Immunodéficience Humaine de type 1)

Résumé

Les traitements actuels de la thérapie anti-VIH sont principalement axés sur la protéase et la transcriptase inverse du virus. Ces composés ne sont actifs que pour les stades avancés de l'infection et, par conséquent, pour prévenir l'infection de la cellule, il est nécessaire de bloquer le processus de l'entrée du VIH-1. Ceci peut être obtenu par l'inhibition des protéines de surface du virus : la gp120 et gp41. Mais, si l'élaboration de nouveaux inhibiteurs d'entrée du VIH-1 est de toute première importance, il convient également de comprendre le mécanisme responsable de la fusion des membranes virale et cellulaire. Dans ce contexte, ce travail de thèse tourne autour du développement d'inhibiteurs originaux des protéines de surface gp120 (dans le chapitre 3) et gp41 (en chapitre 4) et la compréhension du processus de repliement de la gp41 (en chapitre 5) en utilisant les outils de la modélisation moléculaire.

The current treatments for anti-HIV therapy are primarily focused on the protease and reverse transcriptase of the virus. These compounds are only active for advanced stages of infection and, therefore, to prevent infection of the cell, it is necessary to block the entry process of HIV-1. This can be achieved by the inhibition of viral surface proteins such as gp120 or gp41. But, if the design of original HIV-1 entry inhibitors is of extreme importance, understanding the mechanism responsible for the fusion of viral and cellular membranes is not less. In this context, this thesis work turns around the development of new inhibitors of surface proteins gp120 (in chapter 3) and gp41 (in chapter 4) and the understanding of the folding process of gp41 (in chapter 5) using the tools of molecular modelling.