Etude du peptidome du stratum corneum humain par une approche protéomique
Auteur / Autrice : | Anne-Marie Hesse |
Direction : | Joëlle Vinh |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Chimie - Physique et chimie analytique |
Date : | Soutenance en 2009 |
Etablissement(s) : | Paris 6 |
Résumé
L’épiderme a pour fonction majeure de garantir à l’organisme une couche protectrice contre les agressions extérieures, via notamment la production du stratum corneum. Pour assurer cette fonction correctement, il existe un équilibre finement régulé entre les kératinocytes qui entrent en différenciation et les cornéocytes qui desquament à la surface de l’épiderme. Le phénomène de desquamation fait intervenir la dégradation des protéines des cornéodesmosomes, jonctions adhésives entre les cornéocytes. Afin de mieux comprendre ce phénomène et de caractériser les protéases impliquées, nous avons développé une approche sans a priori qui repose sur les outils de la protéomique pour l’étude des peptides endogènes. Pour cela, nous avons développé le couplage entre la chromatographie multidimensionnelle en phase liquide et la spectrométrie de masse en tandem à transformée de Fourier. Différentes approches ont été évaluées pour les analyses protéomiques. Nous avons ainsi pu mettre en évidence l’intérêt spécifique et la complémentarité de ces techniques analytiques dans l’étude de protéomes complexes. La découverte des peptides endogènes du stratum corneum a permis de montrer que les protéines des cornéodesmosomes étaient particulièrement dégradées par rapport aux autres protéines de ce tissu. Cette dégradation concerne des zones clefs pour l’adhésion des protéines entre elles. L’étude plus fine des sites de coupure observés a permis de mettre en évidence les protéases impliquées.