Diversité métabolique au sein de l'espèce Escherichia coli : implications dans les capacités d'adaptation et la virulence

Metabolic diversity in Escherichia coli species : involvement in adaptation and virulence

• Auteur / Autrice : Cécile Aubron
• Direction : Odile Hablot-Bouvet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Paris 5

Mots clés

Mots clés contrôlés

Escherichia coli

Infections urinaires

Stress oxydatif

Résumé

Nous effectuons une étude de la diversité métabolique de divers isolais de E. Coli afin (i) d'établir un lien entre métabolisme et virulence et, (ii) de mieux comprendre la physiopathologie des infections urinaires (IU). Les activités enzymatiques spécifiques d'enzymes du métabolisme central sont mesurées à la phase exponentielle dans 4 milieux pour 5 souches. Une diversité intra espèce du métabolisme et des capacités d'adaptation est mise en évidence. Elle peut être rattachée au phénotype pathogène ou commensal et à la niche. E. Coli CFT073, uropathogène, favorise le métabolisme de l'acétate et les voies de biosynthèse dans l'urine. L'évaluation de l'homéostasie redox de 8 souches montre que la phase exponentielle, par rapport à la phase stationnaire de la croissance dans l'urine, est associée à un déséquilibre de l'homéostasie redox. Un stress systémique modifie la composition de l'urine, favorisant la croissance de E. Coli qui pourrait participer à la survenue d'IU en réanimation.

We carry out a study of the metabolic diversity for some strains of E. Coli, in order to (i) point out a link between metabolism and virulence and, (ii) improve our understanding of urinary tract infections (UTI). The specific activity of some enzymes from the central metabolism was measured for 5 strains yielded in 4 mediums. We highlight a metabolic diversity, which could be linked to strain's habitats or pathovars. The uropathogenic strain, E. Coli CFT073, favours acetate metabolism and neoglucogenesis during growth in urine. The study of redox homeostasis for 8 E. Coli strains shows an unbalance during exponential phase by comparison with stationary phase. A systemic stress, such as a polytraumatism, is responsible for changes in urine composition, which could be a risk factor of UTI occurrence in unwell intensive care patients.