Etudes de systèmes organométalliques et biologiques par des méthodes hybrides mécanique quantique/mécanique moléculaire
Résumé
In the recent years the hybrid QM/MM methods, which combine the quantum mechanics (QM) with molecular mechanics (MM), have emerged as a promising route for studying complex biological and chemical systems containing more than a few hundreds atoms. In the present manuscript we showed their advantages and shortcomings in studying various problems, ragging from the modelization of phosphine ligands, enzymatic reactivity of the purple acid phosphatase and the modelization of protein-ligand interaction between the casein kinase 2 protein and its inhibitors.
Ces dernières années, les méthodes hybrides QM/MM combinant la mécanique quantique (QM) et la mécanique moléculaire (MM) se sont revélées des méthodes de choix pour l'étude de systèmes chimiques et biochimiques contenant plus d'une centaine d'atomes. Nous avons mis en évidence les apports et difficultés liés à leur utilisation à travers des systèmes variés: modélisation de ligands phosphines, réactivité d'une protéine de type acide phosphatase pourpre, modélisation de l'interaction protéine-ligand.
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