Impact de la sélection sur l'expression et la variabilité de séquence de gènes de la voie de biosynthèse des carotenoïdes chez la carotte cultivée

Impact of selection on expression and sequence variability of carotenoid biosynthesis genes in cultivated carrot

• Auteur / Autrice : Jérémy Clotault
• Direction : Didier Peltier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie cellulaire et végétale
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Angers
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire UMR 1259 GenHort (génétique et horticulture), université d'Angers, INRA/INHP

Mots clés

Mots clés contrôlés

Variabilité génétique

Caroténoïdes

Variétés

Carotte

Mots clés libres

Expression

Sélection

Résumé

La domestication puis la sélection de la carotte a abouti à une diversité de couleur des types variétaux cultivés associée à une grande variabilité de la teneur en caroténoïde dans la racine. Les gènes de la voie de biosynthèse des caroténoïdes sont donc susceptibles d'être impliqués dans les différences de teneur en caroténoïdes chez la carotte et d'avoir été la cible de la sélection au cours de l'amélioration variétale. Les objectifs de cette thèse sont de connaître le rôle des variations transcriptionnelles des gènes de la voie de biosynthèse des caroténoïdes dans l'accumulation de caroténoïdes au cours du développement de racines de différentes couleurs, et de déterminer l'impact de la sélection et de l'histoire démographique de l'espèce, notamment la structuration génétique, sur la variabilité de séquence des gènes de la voie de biosynthèqe des caroténoïdes chez la carotte cultivée. . . .

Carrot domestication and breeding have led to a diversity of cultivated carrot types exhibiting a high variability for carotenoid content in the root. Carotenoid biosynthesis genes are probably involved in carotenoid level differences, and could have been a selection target for plant breeding. The objectives of this thesis were to investigate the role of transcriptional variations for carotenoid biosynthesis genes on carotenoid accumulation during root development in variously coloured carrots, and to characterise the impact of selection and demographic history, particularly genetic structure, on carotenoid biosynthesis gene sequence variability in cultivated carrots. . . . .