Etude de la transcription de Rickettsia conorii dans différentes conditions in vitro et in vivo

Study of Rickettsia conorii transcription in different conditions in vitro and in vivo

• Auteur / Autrice : Clarisse Rovery
• Direction : Patricia Renesto
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Maladies transmissibles et pathologies tropicales
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 2

Mots clés

Mots clés contrôlés

Séquençage par oligonucléotides en batterie

Transcription génétique

Analyse de profil d'expression de gènes

Rickettsia conorii

Fièvre boutonneuse

Résumé

Rickettsia conorii, l’agent causal de la fièvre boutonneuse méditerranéenne, est transmis aux humains par la morsure de Rhipicephalus sanguineus. Le séquençage du génome de ces bactéries intracellulaires strictes a permis de mieux comprendre leur phylogénie et de développer des approches post-génomiques (transcriptomique, protéomique). Le but de cette thèse était de mieux comprendre la pathogénicité de ces microorganismes en étudiant le transcriptome de R. Conorii dans différentes conditions. Nous avons pu montrer en reproduisant in vitro des conditions de stress de la bactérie que la transcription des gènes spoT ainsi que l’expression de rOmpA, une protéine majeure de surface variaient en fonction de ces conditions. Nous avons pu ensuite valider une méthode d’analyse globale du transcriptome de R. Conorii en utilisant une ‘mini-puce à ADN’. L’utilisation d’une puce à ADN correspondant à la totalité du génome nous a permis pour la première fois d’étudier la transcription de l’ensemble des gènes de R. Conorii in vivo dans des escarres prélevées chez des patients présentant une fièvre boutonneuse méditerranéenne. Nos résultats ont montré que R. Conorii avait un profil transcriptionnel remarquablement conservé quels que soit les patients atteints, et quel que soit le génotype en cause. Etant donné que l’escarre est le site d’introduction des rickettsies, l’analyse du profil transcriptionnel observé dans cette étude illustre en partie la fac��on dont les rickettsies contre-attaquent le système de défense de l’hôte. Globalement, nous pensons que ces résultats contribuent à une meilleure connaissance des capacités d’adaptation et de la pathogénicité de R. Conorii.