Nouvelles méthodologies en protéomique pour une caractérisation fine des protéines

New methodologies in proteomics for the fine characterization of proteins

• Auteur / Autrice : Audrey Bednarczyk
• Direction : Alain Van Dorsselaer
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance en 2008
• Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Interactions protéine-protéine

Cartographie d'interactions entre protéines

Maturation post-traductionnelle des protéines

Chromatographie en phase liquide

Spectrométrie de masse

Cheveux

Kératines

Glycosylation

Protéines -- Conformation

Structure

Protéines -- Modifications posttraductionnelles

Protéines

Protéomique

Résumé

Les nouveaux besoins en analyse protéomique résident dans une caractérisation toujours plus fine des protéines ce qui inclus l’identification de modifications post-traductionnelles (PTMs). Ainsi, deux sujets ont été abordés : La caractérisation de N-glycoprotéines dont l’importance dans les systèmes biologiques n’est plus à démontrer. Ces études ont été réalisées sur une hormone de fécondité la FSH, un anticorps monoclonal, une protéine allergène et le parasite Toxoplasma Gondii. Le protéome du cheveu humain jamais été étudié en protéomique du fait de la complexité et de la nature des protéines. Nous avons mis au point des méthodes analytiques pour identifier les protéines de la tige capillaire, et cela pour mieux comprendre la structure du cheveu en termes de localisation des protéines, modifications des protéines et interactions protéines-protéines. Ainsi nous avons pu caractérisé plusieurs PTMs (méthylation, oxydation) et des connections inter-chaînes peptidiques.

One of the new challenges in proteomics consists in the full characterization of proteins which include the identification of post-translational modifications (PTMs). Thus, two subjects were explored during this PhD thesis: The characterization of N-glycoproteins for which ones the importance in protein function is well established: A number of studies were performed on the follicle stimulating hormone, a monoclonal antibody, a allergenic protein and Toxoplasma Gondii. The human hair proteome: Complementary analytical methods were developed to identify all the proteins present in the hair shaft in order to better understand this complex network. In particular; protein-protein interactions, localization of some proteins, and the type of modifications occurring on human hair proteins have been elucidated from this study.