Etude sur pince magnétique de la jonction de Holliday : les interactions de la jonction avec la protéine MutS ou la protéine RecG

Study of the Holliday junction with magnetic tweezers : the junction's interactions with MutS protein and RegG protein

• Auteur / Autrice : Camille Breme
• Direction : François Heslot
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Concepts fondamentaux de la physique
• Date : Soutenance en 2008
• Etablissement(s) : Paris 6

Mots clés

Mots clés libres

Adn

Jonction de Holliday

Pince magnétique

Muts

RecG

Fourche de réplication

Résumé

Ce travail présente l'étude à l'echelle de la molécule unique la jonction de Holliday, et de ses interactions avec les protéines MutS et ReG. Nous commençons par le comportement de la jonction de Holliday. La présence au niveau du centre de la jonction d'une hétérologie entre les séquences suffit à bloquer la migration sous certaines conditions expérimentales. Ce phénomène nous permet de détecter les hétérologies de séquences entre deux molécules. Nous avons étudié l'interaction entre une molécule d'ADN présentant une jonction de Holliday, et la protéine MutS. La présence de MutS bloque la migration lorsqu’un mésappariement arrive au niveau du centre de la jonction. La protéine RecG est une hélicase qui intervient dans le sauvetage des fourches de réplication. Des études suggèrent sa capacité à faire rebrousser les fourches de réplication arrêtées. Nous avons étudié ces réactions à l'échelle de la molécule unique. Nous avons observé la migration de la jonction. Cela nous a permis d'effectuer une mesure directe de la vitesse de l'enzyme, sa processivité et le couple maximal fourni par l'enzyme. Nous avons étudié la dépendance en concentration d'ATP et d'enzyme