Etude du sous-site S1 de l'aminopeptidase A par modélisation moléculaire et mutagenèse dirigée. Exploration de la spécificité de substrat de cette enzyme
Auteur / Autrice : | Cédric Claperon |
Direction : | Catherine Llorens-Cortes |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biochimie. Biologie moléculaire et cellulaire |
Date : | Soutenance en 2008 |
Etablissement(s) : | Paris 5 |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale du Médicament (....-2009Paris) |
Partenaire(s) de recherche : | Autre partenaire : Université Paris Descartes. Faculté de pharmacie de Paris (....-2019) |
Mots clés
Résumé
L’aminopeptidase A est une glycoprotéine homodimérique intégrale de type II appartenant à la famille des aminopeptidases monozincs. Elle possède deux caractéristiques : elle est activée par le calcium et présente une spécificité de substrat pour les résidus N-terminaux acides qui devient stricte en présence de calcium. L’utilisation d’inhibiteurs spécifiques et sélectifs de l’APA a permis de démontrer que cette enzyme est impliquée in vivo dans la conversion de l’angiotensine II cérébrale en angiotensine III. L’APA cérébrale se présente donc comme une cible thérapeutique potentielle pour le traitement de l’hypertension. Ainsi, la conception de composés capables de franchir la barrière hémato-encéphalique, d’inhiber dans le cerveau l’APA et de bloquer la conversion de l’angiotensine II en angiotensine III, pourraient constituer une nouvelle classe d’antihypertenseurs à action centrale. Afin de développer de tels composés, l’étude de l’organisation du site actif de l’APA a été entreprise. L’introduction d’un atome de calcium dans le modèle 3D a permis de visualiser une poche hydrophile, dans laquelle l’atome de calcium est lié par l’Asp-213 et l’Asp-218. L’implication de ces résidus dans la liaison du calcium et dans la spécificité de substrat de l’APA a été vérifiée par des expériences de mutagénèse dirigée. L’analyse du modèle nous a permis de visualiser, au sein du sous site S1, un autre résidu, la Thr-348, qui semble impliquer dans la spécificité de substrat pour les résidus N-terminaux acide de l’APA. La validation du rôle de la Thr-348 a été effectuée par mutagénèse dirigée