Etude structurale du système d'efflux membranaire MexXY-OprM impliqué dans la résistance aux antibiotiques chez Pseudomonas aeruginosa

Structural study of the antibiotics resistance mediated by membrane efflux pump MexXY-OprM from Pseudomonas aeruginosa

• Auteur / Autrice : Gilles Phan
• Direction : Arnaud Ducruix
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie structurale
• Date : Soutenance en 2008
• Etablissement(s) : Paris 5
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale du Médicament (....-2009Paris)
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université Paris Descartes. Faculté de pharmacie de Paris (....-2019)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Résistance aux antibiotiques

Pseudomonas aeruginosa

Protéines membranaires

Mots clés libres

Pompe d'efflux

Cristallographie des rayons X

Analyse des modes normaux

Résumé

La bactérie à Gram-negatif Pseudomonas aeruginosa est un pathogène opportuniste impliqué dans les infections nosocomiales et touchant essentiellement les individus immunodéprimés. Parmi les mécanismes de résistance aux antibiotiques, leur efflux actif par un système de transport transmembranaire appelé Mex (Multi-drug Efflux pump) a pris une grande importance clinique. Ces systèmes d’efflux sont constitués d’un assemblage de trois protéines différentes : une porine de la famille OMF (Outer Membrane Factor), un transporteur de la famille RND (Resistance Nodulation Division) localisé dans la membrane interne et un adaptateur périplasmique de la famille MFP (Membrane Fusion Protein) assurant la cohésion du système. Le sujet de thèse porte sur l’étude structurale, essentiellement par cristallographie RX, de la pompe d’efflux MexXY-OprM qui présente la particularité d’être spécifique aux antibiotiques de la famille des aminoglycosides.

The Gram-negative bacteria Pseudomonas aeruginosa is a notoriously opportunistic human pathogen mainly implied in hospital infection. It has been largely shown that this organism exhibits resistance to multiple antimicrobial agents, generally attributable to the expression of a membrane efflux pump called Mex (Multi-drug Efflux pump). A representative efflux pump consists in tripartite assembly : an outer membrane channel-forming protein of the OMF family (Outer Membrane Factor), an inner membrane drug-proton antiporter belonging to the RND transporter family (Resistance Nodulation Division) and a periplasmic protein of the MFP family (Membrane Fusion Protein) which consolidates the whole system. Mainly by X-ray crystallography method, the thesis focuses on the structurally uncharacterized MexXY-OprM efflux pump that is particular because of its specific resistance toward aminoglycoside antibiotic family.