Thèse soutenue

Etude du microbiote intestinal résident chez des prématurés et influence de la stomie sur la flore intestinale et la translocation bactérienne

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Auteur / Autrice : Nathalie Fontaine
Direction : François Eb
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences et Santé. Bactériologie
Date : Soutenance en 2008
Etablissement(s) : Amiens

Résumé

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Ce travail étudie dans un premier temps l'implantation et l'évolutivité du microbiote intestinal chez des prématurés hospitalisés. La flore est composée de staphylocoques à coagulase négative, d'entérocoques, de streptocoques et d'entérobactéries. La flore anaérobie n'a jamais été isolée par les techniques culturales classiques mais les bifidobactéries ont été retrouvées chez 77,7% des enfants par PCR multiplexe. L'implantation de la flore n'est pas influencée par le mode d'accouchement, le type d'alimentation ou la durée d'hospitalisation mais l'est par l'antibiothérapie. Le deuxième objectif de ce travail a été d'évaluer les conséquences de l’iléostomie (I) sur la flore intestinale et la translocation bactérienne (TB) chez des enfants atteints d'entérocolite ulcéro-nécrosante, puis de l'I et de la colostomie (C) sur le microbiote intestinal et la TB chez le rat. Pour les enfants sans complication post-opératoire, une flore intestinale "normale" s'est réimplantée et le segment d'aval a été "décontaminé" ou "stérilisé" ; aucun enfant n'a présenté de TB. Pour le groupe hospitalisé jusqu'au rétablissement de la continuité digestive, la flore intestinale est composée d'espèces "hospitalières" et résistantes aux antibiotiques attestant d'un dysmicrobisme intestinal semblant promouvoir la TB mais aucun épisode bactériémique n'est rapporté. L'I et la C chez le rat ont mis en évidence des modifications de la flore iléale et colique avec des effets délétères sur la flore bénéfique. Concernant la TB, on ne note aucune différence significative pour le groupe C alors que des bactéries aéro-anaérobies facultatives sont retrouvées au niveau de la rate et du foie dans le groupe I.