Whole genome detection and logical analysis of chordate cis-regulatory regions : application to the identification of FGF direct targets in embryos

• Auteur / Autrice : Pierre Khoueiry
• Direction : Patrick Lemaire
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Bioinformatique. Biologie structurale et génomique
• Date : Soutenance en 2008
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 2
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Chromatine

Épigénétique

Biologie du développement

Transcription génétique

Résumé

Le séquençage des génomes eucaryotes a permis d'aborder le déchiffrement du code génétique, composé d'ensemble de règles par lesquelles les acides désoxy- ribonucléiques (ADN) sont traduits en acides aminés qui composeront la protéine. Cependant, ce code génétique ne permet pas d'expliquer pourquoi, quand et où la protéine est traduite. Ces informations sont codées par un autre code appelé « code régulateur ». Le déchiffrement du code régulateur pourrait avoir des impacts majeurs dans la compréhension des processus de développement, d'évolution et pathologiques. Cependant, cette tâche est particulièrement difficile en raison de la complexité de la régulation de la transcription des gènes. Par exemple, la seule étape d'initiation de la transcription implique des interactions de nature combinatoire entre des dizaines de protéines et la molécule d'ADN ainsi que des modifications de nature épigénétique, indépendante de la séquence d'ADN, induisant des changements de structure de la chromatine.