Thèse soutenue

Etude in silico de l'allostérie et des changements conformationnels de grande envergure dans les intégrines
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Auteur / Autrice : Thomas Gaillard
Direction : Roland StoteAnnick Dejaegere
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Chimie
Date : Soutenance en 2007
Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Les intégrines sont des protéines transmembranaires qui jouent un rôle primordial dans l'adhésion cellulaire. Des études expérimentales ont montré qu'elles se comportaient comme des commutateurs bidirectionnels allostériques et subissaient de grands changements conformationnels. L'objectif de ce travail est d'analyser les changements de conformation qui accompagnent le fonctionnement des intégrines par la modélisation moléculaire. De multiples structures du I-domaine ont tout d'abord été soumises à une analyse comparative en modes normaux. La dynamique des domaines I-like et Hybrid a ensuite été étudiée par une analyse quasi-harmonique. Enfin, l'activation de la partie extracellulaire complète de l'intégrine a été étudiée par dynamique moléculaire ciblée. Le travail réalisé apporte un point de vue nouveau sur la dynamique des intégrines et permet d'améliorer la connaissance des mécanismes moléculaires réalisant le couplage entre la conformation et l'affinité pour les ligands.