Recherche de marqueurs protéomiques tumoraux : application en neuro-oncologie

Innovative developments in clinical proteomics applied to neuro-oncology

• Auteur / Autrice : Ali Bouamrani
• Direction : François Berger
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance en 2007
• Etablissement(s) : Université Joseph Fourier (Grenoble, Isère, France ; 1971-2015)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Protéomique

Marqueurs biologiques

Tumeurs cérébrales

Spectrométrie de masse

Résumé

La protéo. Mique est un complément indispensable de l'analyse du transcriptome. En effet, les protéines sont les acteurs fonctionnels des processus biologiques et permettent de mieux comprendre la physiopathologie cancéreuse. Les progrès technologiques récents en spectrométrie de masse permettent de nouvelles approches pour la découverte de biomarqueurs tumoraux qui amélioreraient la prise en charge des patients. La technologie SELDI-TOF MS associant la spectrométrie de masse et l'affinité des protéines pour des matrices chromatographiques, est une approche rapide, sensible et reproductible pour l'analyse du protéome. A l'aide de cette technologie, nous avons réalisé l'étude d'échantillons sériques et tissulaires de tumeurs cérébrales humaines (gliomes et méningiomes). Nous avons pu mettre en évidence, sur des études encore préliminaires, des profils protéiques spécifiques des gliomes et de la réponse thérapeutique. De plus, nous avons identifié la Vimentine dans sa forme phosphorylée comme marqueur de non invasivité des méningiomes. Nous avons également développé des approches d'analyses protéomiques des tissus tumoraux compatibles avec les micro-prélèvements et qui pourraient compléter les examens anatomopathologiques actuels. La sensibilité des méthodes d'analyse en spectrométrie de masse associée à la technologie du silicium développée au CEA-LETI nous a conduit à réaliser un procédé innovant de biopsie moléculaire in vivo sans prélèvement de tissu. Cette approche permettra, une fois validée, d'effectuer une analyse moléculaire dans des zones encore inaccessibles telles aue les réaions cérébrales orofondes ou la oériohérie tumorale.

Tissue analysis remains a standard procedure in the classical anatomoclinical methods currently supporting most of our therapeutical decision. However histological diagnosis of the pathology is sometime limited and need to be completed by molecular investigations. The development of micro-invasive technologies su ch as stereotactic biopsy reduces dramatically the amount of tissues available for diagnosis. To further optimize the clinical compatibility of SELDI-TOF MS profiling with microsamples, we introduced a new strategy consisting in direct analysis of fresh tissue apposition performed extemporaneously in the surgery room as well as apposition of 10 !lm cryostat section on the proteinchip. We also developped a new micro invasive tool for molecular analysis of functional areas without tissue removal. This molecular fingerprint obtained from cerebral tissue during stereotaxic surgery could have scientific interest in investigations of neurodegenerative pathologies such as Parkinson disease. Ln conclusion, we developed a new fingerprint tool for molecular investigation procedures without tissue removal, and we validated innovative strategies for proteomic analysis compatible with micro-invasive technologies offering a molecular complement to the anatomopathological diagnosis. These innovations were patented, providing potential industrial developments.