Identification insilico et validation expérimentale de gènes spécifiquement exprimés dans l'ovocyte de mammifères : les MATER-like et les oogénésines

In silico identification and experimental validation of genes specificully expressed in mammalian oocytes : the maternal antiyen that embryo requires-like and the oogenesins

• Auteur / Autrice : Sébastien Dade
• Direction : Philippe Monget
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la vie
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Tours

Mots clés

Mots clés contrôlés

Leucine

Ovogenèse

Ovules

Résumé

Grâce à l'augmentation exponentielle des séquences disponibles dans les banques de données d'une part et le développement de logiciels permettant leur analyse d'autre part, nous avons généré in silico une liste de gènes candidats potentiellement spécifiques de l'ovocyte. Ceci a pu se faire grâce à l'utilisation d'un outil de soustraction de banques d'EST depuis le site du NCBI (http:/www. Ncbi. Nlm. Nih. Gov/), le Digital Differential Display (DDD). Ces gènes candidats ont fait l'objet l'études expérimentales pour un certain nombre d'entre eux, notamment des gènes simulaires à NALP5/MATER et des mettres d'une nouvelle famille de gènes, les oogénésimes.

Thanks to exponential rise of available sequences from data banks and software develpment allowing their analysis, we generated in silico a list of genes potentially ooyte-specific. It was made made thanks to a substraction tool of EST bank since NCBI web site (http://www. Ncbi. Nlm. Nih. Gov/), le Digital Differential Display (DDD). Most of these candidate genes were experimentally studied notably MATER-like genes and members of a new genes family, the oogenesins.