Thèse soutenue

Étude du codage dans l'ADN

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Auteur / Autrice : Guillaume Sicot
Direction : Ramesh Pyndiah
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Traitement du signal et télécommunications
Date : Soutenance en 2006
Etablissement(s) : Télécom Bretagne

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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L'acide désoxyrobonucléique ou ADN est le support de l'information génétique. Ceci résume le fait que l'ADN contient l'information nécessaire à l'élaboration des protéines, constituants essentiels de tout être vivant. Les protéines apparaissent comme une succession d'acides aminés, dont l'enchaînement est déterminé par les séquences ADN. La traduction des séquences ADN en acides aminés se fait suivant des règles définies par le code génétique. Dans un premier temps, cette thèse étudie d'éventuelles analogies entre des éléments de la génétique, tel que le code génétique, et des techniques propres aux communications numériques et à la théorie de l'information. Notre analogie s'est portée en particulier sur le codage de source et le codage de canal. En ce qui concerne le codage de source, nous nous sommes inspirés des codes multiplexés afin de quantifier, tout d'abord, le pouvoir de compression du code génétique, puis la redondance résiduelle. Pour le codage de canal, l'étude s'est intéressée à essayer de mettre en évidence l'existence de corrélations comparables à celles présentes dans les codes correcteurs d'erreurs utilisés en communications numériques. Dans un second temps, notre étude s'est portée sur les propriétés statistiques des séquences ADN. En effet la molécule d'ADN est contituée de deux brins complémentaires. Nous avons mis en évidence des propriétés statistiques particulières suivant le brin et le sens de lecture sur les parties codantes et non codantes de l'ADN. On montre de plus que ces propriétés ne peuvent être reproduites avec des générateurs de séquences utilisant des modèles classiques.