Herpèsvirus Humain 8 : épidémiologie moléculaire et analyse de la clonalité virale et cellulaire des pathologies associés

Human herpesvirus 8 : molecular epidemiology and viral and cellular clonalities analyses of associated pathologies

• Auteur / Autrice : Renan Duprez
• Direction : Antoine Gessain
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie et virologie
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Paris 7

Mots clés

Mots clés contrôlés

Rhadinovirus

épidémiologie

Maroc

Analyse de séquence d'ADN

ADN viral

Sarcome de Kaposi

Clones cellulaires

Herpèsvirus humain de type 8

Résumé

L'herpèsvirus humain 8 (HHV-8) est un virus appartenant à la sous-famille des γ-herpesvirinae et au genre Rhadinovirus (y2-herpesvirinae). La première partie de cette thèse traite de la caractérisation d'un virus de gibbon (HyloRV2) appartenant au génogroupe RV2 des Rhadinovirus qui conduit à suspecter, du fait de la coévolution herpèsvirus/hôte, l'existence d'un herpèsvirus humain au sein de ce génogroupe RV2. La seconde partie, phylogénétique, s'intéresse à 37 nouvelles ORFK1 d'HHV-8 provenant principalement de patients du Maroc mais également de Guyane Française et de Wallis et Futuna, régions du monde pour lesquelles nous ne disposions que de très peu d'informations quant à la variabilité moléculaire de l'HHV-8. Une méta-analyse de la totalité des séquences disponibles de l'ORFKI nous permet de remettre en question la classification actuelle en groupes et sous-groupes de l'HHV-8. La détermination d'une nouvelle classification, parallèlement à la caractérisation de nouvelles souches virales nous permettront de mieux comprendre l'histoire évolutive de ce virus ainsi que ses modes de dissémination. Enfin, la dernière partie de ce travail s'intéresse à la clonalité des pathologies liées à l'HHV-8. Sur la base d'une technique d'étude de la clonalité virale HHV-8 comme marqueur de la clonalité cellulaire, nous avons analysé la clonalité de 15 prélèvements de PEL et de 139 prélèvements de SK. Nous avons montré que les proliférations étudiées correspondent à des proliférations mono ou oligoclonales pour l'HHV-8. D'autre part, un travail, bien que préliminaire et basé sur un modèle in vitro, pourrait remettre en cause le rôle « initiateur » de l'HHV-8 dans le PEL.

Human Herpesvirus 8 (HHV-8) belongs to the subfamily y-herpesvirinae and to the genus Rhadinovirus (y2-herpesvirinae). The first part of this work concerns the characterization of a gibbon virus (HyloRV2) which belongs to the RV2 genogroup of the Rhadinovirus. Because of the coevolution of herpesviruses and their hosts, this discovery raises the suspicion of the existence of a yet undiscovered human herpesvirus in the RV; genogroup. The second part of this work concerns phylogenetic projects. We have analyzed 37 new ORFK 1 HHV-8 sequences coming mainly from Moroccan patients, but also from French Guyana and Wallis & Futuna, regions of the world for which there was very little information concerning molecular variability of HHV-8. The meta-analysis that we carried out using all the available ORFK1 sequences allowed us to contest the current classification of HHV-8 groups and sub-groups. The determination of a new classification, in parallel with the characterization of new viral strains will allow a better understanding of the evolutionary history of this virus, a; well as its dissemination modes. The last part of this work is about the clonality of HHV-8 related pathologies We have used the viral clonality of HHV-8 as a marker of cellular clonality. We analyzed the clonality of 15 PEL and 139 SK samples. We showed that these proliferations are monoclonal or oligoclonal for HHV-8. These in vitro results could led us to re-evaluate de ''initiator'' role of HHV-8 in PEL.