Plasmodium falciparum : polymorphisme génétique de transporteurs en relation avec la sensibilité à l'artémisinine et à la chloroquine et étude du transcriptome lors d'un stress à l'atovaquone

Plasmodium falciparum: genetic polymorphism of putative transporters in susceptibility of artemisinin and chloroquine and study of the transcriptome after atovaquone stress

• Auteur / Autrice : Sandrine Cojean
• Direction : Rémy Durand
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Pharmacie. Parasitologie
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Paris 5
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale du Médicament (....-2009Paris)
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université Paris Descartes. Faculté de pharmacie de Paris (....-2019)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Atovaquone

Chloroquine

Artémisinine

Résistance aux antipaludiques

Plasmodium falciparum

Résumé

La compréhension de la résistance aux antipaludiques est indispensable pour mieux gérer les antipaludiques actuels et rechercher de nouvelles molécules. Les objectifs de ce travail sont d’étudier : (i) l’association de polymorphismes génétiques dans des transporteurs potentiels de Plasmodium falciparum avec la résistance à la dihydroartémisinine et à la chloroquine; (ii) la diffusion du génotype chloroquino-résistant (Pfcrt) en Afrique ; (iii) le transcriptome de la souche 3D7 soumise à un stress par l’atovaquone. La présence de la mutation S769N du gène Pfatp6 et le polymorphisme en position 1390 du gène du transporteur G7 n’ont pas été associés avec la diminution de la sensibilité in vitro à la dihydroartémisinine dans des isolats provenant d’Afrique. Nous n’avons pas mis en évidence d’association entre la sensibilité in vitro à la chloroquine et les polymorphismes génétiques des gènes de transporteurs G7, G25, G30, G49, G54, G55, G70. Cependant, l’haplotype CVIET/S de Pfcrt et la mutation ponctuelle N86Y de Pfmdr-1 ont été associés à la résistance in vitro à la chloroquine. Nous avons confirmé, au moyen d’un marqueur microsatellite, qu’un haplotype unique de Pfcrt, CVIET/S/(TAAA)3(TA)15, a diffusé à travers l’Afrique à partir du foyer asiatique de la résistance à la chloroquine. L’analyse du transcriptome d’un clone 3D7 sensible (CI50 = 0. 7 nM) et d’un clone 3D7 résistant (CI50 = 162 nM) soumis à un stress à l’atovaquone a montré des variations d’expression significatives du gène Pfcytb et du gène de la dihydroptéroate synthase. Six gènes de transporteurs ont présenté des variations d’expression. Après confirmation, ces résultats pourraient conduire à une meilleure connaissance du mécanisme d’action antipaludique

The comprehension of drug resistance is essential for managing the current antimalarial drugs and searching new compounds. This work aimed to study: (i) the association of genetic polymorphisms in putative transporters of Plasmodium falciparum with resistance to dihydroartemisinin and chloroquine; (ii) the migration of the chloroquino-resistant genotype (Pfcrt) in Africa; (iii) the transcriptome of 3D7 strain after atovaquone stress. The S769N mutation of Pfatp6 gene and polymorphism in position 1390 of G7 gene were not associated with the in vitro susceptibility to dihydroartemisinin in our isolates from Africa. We did not find an association between the in vitro susceptibility to chloroquine and genetic polymorphisms of putative transporters genes. However, haplotype CVIET/S of Pfcrt and N86Y mutation of Pfmdr-1 were associated with in vitro resistance to chloroquine. We confirmed by using a microsatellite marker the migration of a single ancestral Pfcrt chloroquine resistance allele from Asia to Africa. The analysis of the transcriptome of a sensitive 3D7clone (IC50 = 0. 7 nM) and a resistant 3D7clone (IC50 = 162 nM) after atovaquone stress showed significant variations of expression of Pfcytb gene and dihydropteroate synthase gene. Six putative transporter genes showed variations of expression. After confirmation, these results could lead to a better knowledge of the action mechanism of atovaquone.