La sous-unité alpha de l'ARN polymérase de Mycobacterium tuberculosis : dimérisation et ciblage de l'interface protéine-protéine pour le développement d'inhibiteurs de la transcription

• Auteur / Autrice : Guillaume Lebon
• Direction : Vehary Sakanyan, Frédéric Marc
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Aspects moléculaire et cellulaire de la biologie
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Nantes
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale chimie biologie (Nantes....-2008)
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université de Nantes. Faculté des sciences et des techniques

Mots clés

Mots clés contrôlés

Mycobacterium tuberculosis

ADN polymérases

Résumé

Nous avons étudié la sous-unité α de l'ARN polymérase de M. Tuberculosis (αMt) en postulant que l'interface protéine-protéine, impliquée dans sa dimérisation, représente une cible attractive pour la création de nouveaux agents antibactériens. La protéine αMt engendre la formation d'un homodimère qui assure l'assemblage du complexe multiprotéique en s'associant avec les autres sous-unités de l'ARN polymérase d'Escherichia coli. Cependant, la sous-unité αMt ne peut pas former d'hétérodimère avec celle d'E. Coli. La modélisation du domaine de dimérisation a permis de prédire la séquence d'inhibiteurs peptidiques ciblant l'interface protéique de l'homodimère αMt. L'effet de ces inhibiteurs a été confirmé in vitro par les méthodes conventionnelles. Une approche, basée sur l'avantage d'une puce à protéine auto-assemblée à partir des monomères αMt synthétisées par un système acellulaire, a été développée pour le criblage de petites molécules, inhibiteurs potentiels de la transcription.

We studied the M. Tuberculosis RNA polymerase α subunit (αMt), postulating that the protein-protein interface implied in its dimerization is an attractive target for the creation of new antibacterial agents. The αMt monomers form a homodimer, which ensures the assembly of the multiproteic complex while binding to other Escherichia coli RNA polymerase subunits. However, the αMt protein cannot form a heterodimer with α subunit of E. Coli. Modelling of the αM. T dimerization domain allowed predicting peptide inhibitor sequences targeting the interface of the homodimer. Effect of these inhibitors was confirmed in vitro by conventional methods. An approach, based on the advantage of protein microarrays self-assembled from the cell-free synthesized αMt monomers, was developed for the screening of small molecules, potential inhibitors of transcription.