Thèse soutenue

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Auteur / Autrice : Shaun David Berry
Direction : Patrice CadetMireille FargetteSerge Morand
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie des populations et écologie
Date : Soutenance en 2006
Etablissement(s) : Montpellier 2

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Une étude de la répartition des espèces de nématodes présentes actuellement sur canne à sucre a révélé que cinq espèces ou genres étaient dominants: Helicotylenchus dihystera, Meloidogyne javanica, Pratylenchus zaea, Paratrichodorus spp. Et Xiphinema spp. . Les proportions relatives des espèces qui constituent cette communauté déterminent l’importance des dégâts. En pot, l’inoculation de Helicotylenchus dihystera a été suivie d’une augmentation de la biomasse aérienne de la canne. Dans un essai au champ, la reproduction des pratiques culturales de récolte employée au Burkina Faso a été suivie d’un accroissement de la proportion relative de Helicotylenchus dihystera et une diminution de celle de Xiphinema elongatum. Mais, l’augmentation du rendement n’a pas été significative. Quant à la technique de récolte employée en Australie, elle conduit aussi à un léger accroissement du rendement, mais qui ne peut pas être expliqué par un impact sur les nématodes. Des techniques moléculaires ont été employées pour identifier les nématodes. Les quantités d’acide nucléiques extraits des espèces de nématodes se sont révélées significativement différentes. L’utilisation de différences dans la taille du ADN résultant de l’amplification de la région ITS1 pour l’identification des espèces n’a pas donné les résultats escomptés et ne peut être utilisé que pour un diagnostique grossier. L’étude de la diversité génétique de cette région a permis d’appréhender les relations phylogénétiques entre espèces. Des différences dans la composition en nucléotides peuvent être exploitées pour développer des amorces spécifiques des différentes espèces utilisables pour des diagnostiques en PCR classique ou quantitative