Etude du mécanisme d'activation de la transcription en réponse aux rétinoïdes

• Auteur / Autrice : Sébastien Flajollet
• Direction : Philippe Lefebvre
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la vie et de la santé. Biologie moléculaire et biochimie
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Lille 2

Mots clés

Mots clés contrôlés

Transcription génétique

Facteurs de transcription

Récepteurs cytoplasmiques et nucléaires

Récepteurs nucléaires (biochimie)

Rétinoïdes

Rétinoïdes

Résumé

Le récepteur à l'acide rétinoïque (RAR) est un facteur de transcription qui module l'expression de gènes impliqués dans différents processus biologiques tels que l'homéostasie cellulaire, le développement embryonnaire, la croissance et la reproduction. RAR interagit, en réponse aux rétinoïdes avec une pléthore de protéines corégulatrices qui participent pleinement au mécanisme complexe et très contrôlé de la transcription. Leur implication dans le remodelage de la chromatine, dansla formation du complexe d'initiation de la transcription ainsi que dans l'activation des différents protagonistes, montre l'importance de la contribution des coactivateurs. Au cours de mon doctorat, je me suis intéressé au recrutement de trois principaux complexes coactivateurs : le complexe p160, le complexe médiateur et le complexe SWI/SNF. Leur implication dans le mécanisme de la transcription induite par les rétinoïdes, bien que connue, était faiblement caractérisée. Mes travaux dans les cellules P19 de carcinome embryonnaire de souris et utilisant la technique d'interférence par ARN ont permis de définir le rôle distinct de SRC1 et med1/DRIP205 dans la réponse aux rétinoïdes. D'autre part ces travaux ont abouti à un modèle de recrutement des coactivateurs et de formation du complexe d'initiation de la transcription au niveau du promoteur du gène suppresseur de tumeur RAR2. Enfin, l'intégration du complexe SWI/SNF dans mon étude a permis de déterminer par des techniques de biologie moléculaire l'interaction physique et fonctionnelle avec le récepteur RAR. Ce travail apporte un éclairage dans la compréhension du mécanisme subtile d'activation de la transcription régulée par les récepteurs aux rétinoïdes.

The Retinoic Acid Receptor (RAR) is a ligand activated transcription factor which modulates the expression of retinoic acid-target genes. These genes are implied in fundamental biological processes such as cellular homeostasis, embryogenesis, growth and reproduction. RAR recruits a plethora of coregulators with multiple functions in response to retinoids. These multiprotein complexes are key structural components in the complex and controlled transcription mechanism. Many of them participate in remodeling of chromatin, while otehrs are implied transcription complex formation. This underlines the importance of these coactivators in transcriptional activation. Yet their contribution to RAR-mediated transactivation remains poorly studied. This PhD thesis focused on the recruitment of three coactivator complexes : P160, mediator and SWI/SNF complex. These proteins are implied in distinct steps of the RAR-mediated process. I investigated this question by assessing the respective role of these coactivators by using molecular and cellular biology approaches in the P19 embryonal carcinoma cell line, an appropriate developmental system to study the role of RARs. Results of knock-down of SRC1 and med1 by RNA interference have demonstrated distinct roles of these coactivator complexes in retinoid-induced biological responses. This allowed us to propose a model summarizing complex formation during transcription initiation at the RARBeta2 promoter, a prototypical retinoic acid-regulated gene. Finally the study of the interaction between the ATP-dependent chromatin remodeling SWI-SNF complex and RAR identified us an additional step in the regulation of transcription by retinoids. Characterization of the role of each coactivators provide important information to better understand this complex regulation of RA-induced transcription.