Identification et caractérisation de nouveaux petits ARNs

Identification and characterisation of novel small nuclear RNAs

• Auteur / Autrice : Mihaly Arnold Kiss
• Direction : Tamás Kiss, Ferenc Solymosy
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie - Santé. Biotechnologie
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Toulouse 3 en cotutelle avec Szeged, Hongrie

Mots clés

Mots clés contrôlés

Épissage (génétique)

Ribosomes

Facteurs de transcription

ARN

Mots clés libres

SnoARN

ScaARN

Modifications post-transcriptionnelles

SnARNs de la machinerie d'épissage

ARNs ribosomiques

Résumé

Les ARNs ribosomiques (ARNr) et les ARNs du spliceosome contiennent de nombreux nucléotides modifiés. Chez les ARNr, les pseudouridines et les nucléotides 2'-O-méthylés sont synthétisés par les snoRNPs (small nucleolar RNPs). Chaque snoRNP est composée d'un ARN guide qui sélectionne les nucléotides cibles par formation d'un appariement. La construction et la caractérisation de banques humaines d'ADNc nous ont permis d'identifier 70 nouveaux ARNs guides putatifs. La majorité des nouveaux ARNs est nucléolaire et guide les modifications des ARNr. Certains ARNs s'accumulent dans les Cajal bodies et sont prédits pour guider les modifications des ARNs du spliceosome. Nos résultats suggèrent que les Cajal bodies soient le lieu de modifications des ARNs du spliceosome. Nous avons également identifié des ARNs guides qui ne possèdent pas de séquences complémentaires aux ARNr ou aux ARNs du spliceosome. Ainsi, ces ARNs peuvent également guider des modifications d'autres types d'ARNs cellulaires.

Ribosomal RNAs (rRNAs) and spliceosomal RNAs contain many post-transcriptionally modified nucleotides. In rRNAs, pseudouridines and 2'-O-methylated nucleotides are synthesised by small nucleolar RNPs (snoRNPs). Each snoRNP contains a guide RNA carrying sequences that select the target nucleotides by formation of base-pairing interactions. By construction and characterization of human cDNA libraries, we have identified 70 novel putative guide RNAs. The great majority of the new RNAs accumulates in the nucleolus and is predicted to function in rRNA modification. Another group of the new guide RNAs accumulates in Cajal bodies and is predicted to direct modification of spliceosomal RNAs. Our results raised the possibility that Cajal body may provide the nuclear locale for modification of spliceosomal RNAs. We have also identified guide RNAs that lack complementarities to rRNAs and spliceosomal RNAs, indicating that guide RNAs also function in modification of other type of cellular RNAs.