Fonction de l'ARNIII dans le contrôle de l'expression des gènes de virulence de Staphylococcus aureus : Analyse des cibles par une approche protéomique
Auteur / Autrice : | Maria Possedko |
Direction : | Pascale Romby, Bernard Ehresmann |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie |
Date : | Soutenance en 2005 |
Etablissement(s) : | Strasbourg 1 |
Mots clés
Résumé
Staphylococcus aureus est une bactérie pathogène provoquant plusieurs types d’infections chez l’homme et les animaux. Sa pathogénie est liée à la synthèse de nombreux facteurs de virulence, dont des toxines, des protéases et des adhésines. L’expression de ces protéines est régulée au cours de la croissance bactérienne par un ARN régulateur, l’ARNIII. Pendant la transition vers la phase stationnaire, cet ARN inhibe la synthèse des plusieurs protéines de la paroi (adhésines) et active l���expression des protéines sécrétées (toxines, enzymes). L'ARNIII régule l'expression des gènes aux niveaux transcriptionnel et post-transcriptionnel, par des mécanismes encore peu élucidés. Pour rechercher d’autres gènes dont l’expression est contrôlée par l’ARNIII, nous avons utilisé une approche protéomique. La comparaison des profils de protéines d’une souche sauvage et d’une souche isogénique délétée de l’ARNIII a montré que l’ARNIII est impliqué dans la régulation de la synthèse non seulement des facteurs de virulence, mais aussi des protéines impliquées dans le métabolisme et dans la réponse au stress. Dans les bactéries, la protéine Hfq est souvent requise pour assister les ARN régulateurs dans leur fonction. Nous avons comparé le profil des protéines de la souche délétée de Hfq avec le profil de la souche n’exprimant pas d’ARNIII. Cette analyse a permis de mettre en évidence plusieurs protéines dont l’expression est dépendante à la fois de l’ARNIII et de Hfq, suggérant que Hfq pourrait agir comme un co-facteur de l’ARNIII. Des évidences expérimentales suggèrent que l’ARNIII est constitué de plusieurs domaines régulateurs. Ainsi, le domaine 3’ est suffisant pour la régulation de l'expression du gène spa. L’analyse du profil protéique de la souche transformée avec ce domaine nous a permis de démontrer que le domaine 3’ est un domaine régulateur multifonctionnel, capable de réguler la synthèse de plusieurs protéines impliquées dans la virulence et le métabolisme cellulaire.