Description de la structure génétiques des populations de sardines européennes, Sardina pilchardus, dans un contexte d'évolution de l'espèce

Description of the genetic structure of populations of european sardines, Sardina pilchardus, in a species evolutionary context

• Auteur / Autrice : Véronique Laurent
• Direction : Serge Planes
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Océanologie
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Perpignan
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Énergie environnement (Perpignan ; 1999-....)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Sardine

Distribution géographique

Évolution

Génétique

Résumé

La sardine européenne, Sardina pilchardus, est une espèce pélagique à grand intérêt économique. Cependant, malgré une importante pêcherie, la structure génétique de cette espèce, son histoire et les limites des stocks sont mal connues et les quelques données déjà présentes sont éparses et contradictoires. Nous avons étudié la structure génétique des populations de sardines dans toute l'aire de répartition ainsi que dans le Golfe de Gascogne. Nous avons mis en évidence l'existence d'au moins deux stocks, un comprenant toutes les populations atlantiques européennes et l'autre en Méditerranée. Les populations périphériques sont génétiquement différentes et constituent probablement des stocks à part entière. Nous avons suivi aussi l'histoire des populations de sardines et nous avons montré que les populations actuelles provenaient d'une forte expansion datant du Pleistocène (100 000 ans). Nous avons remarqué aussi un actuel rétrécissement de la taille de la population mais nous ne pouvons pas tirer de conclusions sur l'origine de cette diminution. Enfin, nous avons montré que la taille efficace des populations de sardines dans le Golfe de Gascogne est importante et était liée à l'abondance des sardines dans le Golfe. Nous avons aussi estimé un taux de dispersion par génération, qui est égal à 103 km. Gen-1. Cette valeur est très importante pour une espèce aquatique et reflète probablement la vie pélagique de cette espèce.

European sardines is a pelagic species with an important economic interest. However, genetic structure, evolutionnary history and stock boundaries are not known. Few data are available and give contradictory informations. We studied genetic structure of populations of sardine in the whole and also in the Bay of Biscay. At least two stocks can be defined in the whole range, an atlantic european stock and a mediterranean one. Peripheral populations are genetically different and likely constitute other stocks but all boundaries are needed to be defined. We studied evolutionary history of populations of sardines and highlighted a recent expansion of the populations from the Pleistocene (100 000 years ago). We showed that the populations are under a phenomenon of population size reduction. We can not conclude if the reduction of the population size reflects the fishing impact or environmental conditions changes. In the Bay of Biscay, we showed the effective population size is high are related to estimate of abundance. We also estimated dispersal rate, equal to 103 km. Gen-1. This value is high comparing other aquatic species and likely reflects the pelagic life of sardines.