Etude structurale par résonance magnétique nucléaire de deux protéines du VIH-1 interagissant avec les acides nucléiques, Vpr et NCp7
Auteur / Autrice : | Sarah Bourbigot |
Direction : | Bernard Roques |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Pharmacie. Pharmacologie moléculaire et structurale |
Date : | Soutenance en 2005 |
Etablissement(s) : | Paris 5 |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale du Médicament (....-2009Paris) |
Partenaire(s) de recherche : | Autre partenaire : Université Paris Descartes. Faculté de pharmacie de Paris (....-2019) |
Mots clés
Résumé
Le cycle de réplication du VIH l'interaction de protéines virales avec l'ARN et l'ADN viraux. Nous avons étudié l'interaction entre Vpr ou la NCp7 et des petits oligonucleotides et le primer binding site (PBS), respectivement. Le PBS forme une tige-boucle et interagit avec la NCp7 lors de la transcription inverse, induisant un transfert de brin. Notre étude montre que la NCp7 glisse entre ses deux sites de liaison sur le PBS, déstabilisant ainsi sa structure pour faciliter le transfert de brin. Vpr interagit avec l'ADN viral et participe à son import dans le noyau des cellules. Après avoir déterminé la structure en ''leucine zipper'' de Vpr(52-96), nous avons montré par RMN, fluorescence et Biacore une interaction entre Vpr(52-96) et les acides nucléiques. La résolution des éléments importants pour l'interaction entre la NCp7 et Vpr et leurs cibles nucléotidiques, pourrait être utilisée dans le cadre de la recherche d'agents anti-viraux.