Etude structurale et fonctionnelle du cluster eps de Streptococcus thermophilus IP6756 : spécificités et hypothèses nouvelles

Structural and functional study of the Streptococcus thermophilus IP6756 eps cluster : specificities and new hypothesis

• Auteur / Autrice : Guillaume Tyvaert
• Direction : Bernard Decaris
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génétique moléculaire
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Nancy 1
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques

Mots clés

Mots clés contrôlés

Polymorphisme génétique

Opérons

Polysaccharides microbiens

Génétique

Streptococcus thermophilus

Résumé

L'organisation du cluster eps de S. Thermophilus IP6756 est très particulière. Ainsi, chez cette souche productrice d'EPS, le module de régulation n'est constitué que de deux des quatre ORF présentes dans les autres clusters eps de l'espèce. De même, le module de biosynthèse et d'export n'est constitué que de deux ORF. Enfin, les produits potentiels de ces ORF ne présentent aucune homologie avec des glycosyltransférases. Sur le plan fonctionnel, le cluster eps de cette souche présente une organisation opéronique. Son interruption s'accompagne du maintien de la production d'EPS. Un ou plusieurs gènes extérieurs au cluster eps seraient donc nécessaires à la biosynthèse des EPS de la souche IP6756, notamment ceux codant les glycosyltransférases nécessaires. Comme les autres clusters eps de S. Thermophilus, le cluster eps de la souche IP6756 contient orf14. 9 dont la fonction est inconnue et qui est transcrite. Les expériences d'interruption réalisées n'ont pas permis d'établir un lien entre la fonctionnalité de cette ORF et la production d'EPS, au moins sur un plan quantitatif. Par contre, il semble que l'intégrité de cette ORF soit nécessaire à une croissance optimale de S. Thermophilus.

The S. Thermophilus IP6756 eps cluster organization is very original. On the one hand in that EPS-producing strain only two ORF compose the regulation module instead of four for other eps cluster of this specie and on the other hand, only two ORF form the biosynthesis-export module. Interestingly, none of those ORF products display glycosyltransferase enzyme homology. Functional study of this cluster shows that it is organized in operon and that its polar interruption does not lead to any modification in EPS yield. All these results indicate that the S. Thermophilus IP6756 eps cluster is not involved in EPS production (on quantitative terms) and that EPS production is under control of gene(s) elsewhere in the genome, particularly glycosyltransferases genes. Like other S. Thermophilus eps clusters, the genome of the IP6756 strain displays orf14. 9, whose function is unknown. This ORF is transcribed. After disruption experiments, no links can be established between this ORF function and EPS production, at least on quantitative term. Nevertheless, orf14. 9 integrity seems to be necessary to an optimal growth of S. Thermophilus.