Création de gènes par réassortiment de modules : caractères chimérique et variable de cse, un gène impliqué dans la ségrégation cellulaire chez la bactérie Streptococcus thermophilus

Gene creation by module shuffling: chimerical and variable nature of cse, a gene involved in cell segregation in the bacterium Streptococcus thermophilus

• Auteur / Autrice : Frédéric Borges
• Direction : Bernard Decaris
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génétique moléculaire
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Nancy 1
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques

Mots clés

Mots clés contrôlés

Ciblage d'un gène

Variabilité génétique

Génétique

Streptococcus thermophilus

Résumé

Nous avons identifié chez Streptococcusthermophilus un gène, nommé cse (Cell Segregation), qui est impliquée dans la ségrégation cellulaire. Ce gène qui code une protéine extracellulaire, présente un caractère chimérique suggèrant qu'il a été générée par réassortiment de fragments de gènes ou modules. Il semblerait que le site de fusion des fragments de gènes à l'origine de cse soit localisé à l'intérieur de la région centrale du gène cse dont la séquence est de faible complexité, riche en répétitions, et variable au niveau intraspécifique. Il a été montré que cette région peut subir d'importantes modifications de sa séquence sans que l'activité de ségrégation cellulaire de la protéine en soit affectée. Nous proposons que la présence, dans les gènes, de régions variables et de faible complexité favorise la génération de nouvelles protéines actives par réassortiment de domaines.

A gene named cse and involved in cell segregation was identified in Streptococcus thermophilus. This gene encodes an extracellular protein which chimerical nature suggests it has been created by domain shuffling. Sequence analysis suggest that the fusion site of the gene fragments originating cse is localized inside a region of the gene which sequence is of low complexity, repeat rich and variable. It was demonstrated that this region can undergoes lot of changes without any consequences on cell segregation activity of the Cse protein. This allowed us to propose that the existence of intragenic sequences displaying variability and low complexity can favor new protein creation by domain shuffling.